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Enregistrement W3005555509 · doi:10.1101/2020.02.10.943209

Differential activation of P-TEFb complexes in the development of cardiomyocyte hypertrophy following activation of distinct GPCRs

2020· preprint· en· W3005555509 sur OpenAlexafffund
Ryan Martin, Ya‐Lin Sun, Sarah MacKinnon, Luca Cuccia, Viviane Pagé, Terence E. Hébert, Jason C. Tanny

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNovartis Institutes for BioMedical ResearchUniversity of California, San DiegoFaculty of Medicine, McGill UniversityMcGill UniversityHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésBRD4P-TEFbCell biologyEnhancerG protein-coupled receptorBiologyBromodomainReceptorRegulation of gene expressionGene expressionTranscription factorChromatinPromoterGeneChemistryMolecular biologySignal transductionEpigeneticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pathological cardiac hypertrophy is driven by neurohormonal activation of specific G protein-coupled receptors (GPCRs) in cardiomyocytes and is accompanied by large-scale changes in cardiomyocyte gene expression. These transcriptional changes require activity of positive transcription elongation factor b (P-TEFb), which is recruited to target genes by the bromodomain protein Brd4 or the S uper E longation C omplex (SEC). Here we describe GPCR-specific regulation of these P-TEFb complexes and a novel mechanism for activating Brd4 in primary neonatal rat cardiomyocytes. The SEC was required for the hypertrophic response downstream of either the α 1 -adrenergic receptor (α 1 -AR) or the endothelin receptor (ETR). In contrast, Brd4 inhibition selectively impaired the α 1 -AR response. This was corroborated by the finding that activation of α 1 -AR, but not ETR, increased Brd4 occupancy at promoters and super enhancers of hypertrophic genes. Transcriptome analysis demonstrated that activation of both receptors initiated similar gene expression programs, but that Brd4 inhibition attenuated hypertrophic genes more robustly following α 1 -AR activation. Finally, we show that protein kinase A (PKA) is required for α 1 -AR stimulation of Brd4 chromatin occupancy. The differential role of the Brd4/P-TEFb complex in response to distinct GPCR pathways has potential clinical implications as therapies targeting this complex are currently being explored for heart failure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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