Spatial and phenotypic characterization of pancreatic cancer-associated fibroblasts after neoadjuvant treatment.
Notice bibliographique
Résumé
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PC) is characterized by a highly fibrotic desmoplastic stroma. Subtypes of cancer-associated fibroblasts (CAFs) have been identified in chemotherapy-naïve PC (CTN-PC), but their precise functions are still unclear. Our knowledge regarding the properties of CAFs in the regressive stroma after neoadjuvant treatment (NAT) of PC (NAT-PC) is particularly limited. We aimed to examine the marker phenotypic properties of CAFs in the regressive stroma of PC. Surgical specimens from patients with CTN-PC (n=10) and NAT-PC (n=10) were included. Juxtatumoural, peripheral, lobular, septal, peripancreatic, and regressive stromal compartments were manually outlined using digital imaging analysis (DIA) for area quantification. The compartment-specific expression of CD271, cytoglobin, DOG-1, miR-21, osteonectin, PDGF-Rβ, and tenascin C was evaluated by immunohistochemistry or in situ hybridization, using manual scoring and automated DIA. The area fraction of the regressive stroma was significantly higher in NAT-PC than in CTN-PC (P=0.0002). CD271 (P<0.01), cytoglobin (P<0.05), DOG1 (P<0.05), miR-21 (P<0.05), and tenascin C (P<0.05) exhibited significant differences in their expression profiles between the juxtatumoural compared to the peripheral and regressive stroma. PDGF-Rβ expression was significantly higher in juxtatumoural than in peripheral CAFs (P<0.05). Our data provide further support of the concept of stromal heterogeneity and phenotypic different CAF subtypes in PC. CAFs in the regressive stroma of NAT-PC show a marker phenotype similar to some (namely, peripheral) and different from other (namely, juxtatumoural) previously defined CAF subtypes. It may be hypothesized that phenotypic CAF subtypes, at least in part, also may share functional properties. Studies examining the precise functional characteristics of CAF subtypes in PC are needed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».