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Enregistrement W3005979307 · doi:10.1111/jbi.13794

Pliocene colonization of the Mediterranean by Great White Shark inferred from fossil records, historical jaws, phylogeographic and divergence time analyses

2020· article· en· W3005979307 sur OpenAlexaff
Agostino Leone, Gregory Neils Puncher, Francesco Ferretti, Emilio Sperone, Sandro Tripepi, Primo Micarelli, Andrea Gambarelli, Maurizio Sarà, Marco Arculeo, Giuliano Doria, Fulvio Garibaldi, Nicola Bressi, A. Dall’Asta, Daniela Minelli, Elisabetta Cilli, Stefano Vanni, Fabrizio Serena, Píndaro Díaz‐Jáimes, Guy Baele, Alessia Cariani, Fausto Tinti

Notice bibliographique

RevueJournal of Biogeography · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueIchthyology and Marine Biology
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesUniversità di BolognaKU Leuven
Mots-clésVicarianceBiological dispersalMediterranean climatePhylogeographyCarchariasLineage (genetic)Land bridgePopulationGeographyMolecular clockBiogeographyPaleontologyEcologyBiologyPhylogenetic tree

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aim Determine the evolutionary origin of the heretofore poorly characterized contemporary Great White Shark (GWS; Carcharodon carcharias ) of the Mediterranean Sea, using phylogenetic and dispersal vicariance analyses to trace back its global palaeo‐migration pattern. Location Mediterranean Sea. Taxon Carcharodon carcharias . Methods We have built the largest mitochondrial DNA control region (CR) sequence dataset for the Mediterranean GWS from referenced historical jaws spanning the 19th and 20th centuries. Mediterranean and global GWS CR sequences were analysed for genetic diversity, phylogenetic relationships and divergence time. A Bayes factor approach was used to assess two scenarios of GWS lineage divergence and emergence of the Mediterranean GWS line using fossil records and palaeo‐geographical events for calibration of the molecular clock. Results The results confirmed a closer evolutionary relationship between Mediterranean GWS and populations from Australia–New Zealand and the North‐eastern Pacific coast rather than populations from South African and North‐western Atlantic. The Mediterranean GWS lineage showed the lowest genetic diversity at the global level, indicating its recent evolutionary origin. An evaluation of various divergence scenarios determined the Mediterranean GWS lineage most likely appeared some 3.23 million years ago by way dispersal/vicariance from Australian/Pacific palaeo‐populations. Main conclusion Based on the fossil records, phylogeographic patterns and divergence time, we revealed that the Mediterranean GWS population originated in the Pliocene following the Messinian Salinity Crisis. Colonization of the Mediterranean by GWS likely occurred via an eastward palaeo‐migration of Australian/eastern Pacific elements through the Central American Seaway, before the complete closure of the Isthmus of Panama. This Pliocene origin scenario contrasts with a previously proposed scenario in which Australian GWS colonized the Mediterranean via antipodean northward migration resulting from navigational errors from South Africa during Quaternary climatic oscillations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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