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Enregistrement W3005996387 · doi:10.1101/683359

Human pluripotent stem cell modeling of tuberous sclerosis complex reveals lineage-specific therapeutic vulnerabilities

2019· preprint· en· W3005996387 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberous Sclerosis Complex Research
Établissements canadiensMcGill University Health CentreCarleton UniversityOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInduced pluripotent stem cellNeural crestBiologyNeural stem cellTuberous sclerosisMesenchymal stem cellCancer researchmTORC1TSC2LymphangioleiomyomatosisTSC1Stem cellPrecursor cellTranscriptomeCell biologyProgenitor cellCellPhenotypeSignal transductionGeneticsGenePathologyPI3K/AKT/mTOR pathwayMedicineEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY mTORC1 hyperactivation resulting from inactivating TSC2 mutations underlie the multi-system tumor disorder tuberous sclerosis complex (TSC) and the rare pulmonary neoplasm lymphangioleiomyomatosis (LAM). Mutation-bearing neural precursor cells (NPCs) lead to the formation of TSC brain tumors during development, while the cell of origin of TSC mesenchymal tumors such as LAM is unknown. We report the first model of multi-system TSC cell types, characterized by NPCs and neural crest cells (NCCs) differentiated in parallel from multiple engineered TSC2 −/− human pluripotent stem cell (hPSC) lines. These cells successfully model defining phenotypes of neural and mesenchymal TSC, with transcriptomic signatures reflecting those observed in patient tumors, thus establishing TSC2 −/− NCCs as a powerful model of LAM. Employing this rich cellular and transcriptomic resource, we identified lineage-specific catabolic signaling mechanisms that drive divergent cell behavior and therapeutic sensitivities that, in turn, demonstrate the power of employing lineage-specific stem cell models to dissect multi-system diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,373
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle