Clades of huge phages from across Earth’s ecosystems
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
. Here we sequenced DNA from diverse ecosystems and found hundreds of phage genomes with lengths of more than 200 kilobases (kb), including a genome of 735 kb, which is-to our knowledge-the largest phage genome to be described to date. Thirty-five genomes were manually curated to completion (circular and no gaps). Expanded genetic repertoires include diverse and previously undescribed CRISPR-Cas systems, transfer RNAs (tRNAs), tRNA synthetases, tRNA-modification enzymes, translation-initiation and elongation factors, and ribosomal proteins. The CRISPR-Cas systems of phages have the capacity to silence host transcription factors and translational genes, potentially as part of a larger interaction network that intercepts translation to redirect biosynthesis to phage-encoded functions. In addition, some phages may repurpose bacterial CRISPR-Cas systems to eliminate competing phages. We phylogenetically define the major clades of huge phages from human and other animal microbiomes, as well as from oceans, lakes, sediments, soils and the built environment. We conclude that the large gene inventories of huge phages reflect a conserved biological strategy, and that the phages are distributed across a broad bacterial host range and across Earth's ecosystems.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle