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Enregistrement W3006103160 · doi:10.1172/jci134066

Distinct immune characteristics distinguish hereditary and idiopathic chronic pancreatitis

2020· article· en· W3006103160 sur OpenAlexaff
Bomi Lee, Julia Z. Adamska, Hong Namkoong, Melena D. Bellin, Joshua J. Wilhelm, Gregory L. Szot, David M. Louis, Mark M. Davis, Stephen J. Pandol, Aida Habtezion

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatitis Pathology and Treatment
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthNational Pancreas FoundationNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesUniversity of MinnesotaHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésImmune systemPancreatitisImmunologyT-cell receptorPathogenesisAcquired immune systemBiologyRepertoireImmunophenotypingInnate immune systemT cellMedicineAntigenInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic pancreatitis (CP) is considered an irreversible fibroinflammatory pancreatic disease. Despite numerous animal model studies, questions remain about local immune characteristics in human CP. We profiled pancreatic immune cell characteristics in control organ donors and CP patients including those with hereditary and idiopathic CP undergoing total pancreatectomy with islet autotransplantation. Flow cytometric analysis revealed a significant increase in the frequency of CD68+ macrophages in idiopathic CP. In contrast, hereditary CP samples showed a significant increase in CD3+ T cell frequency, which prompted us to investigate the T cell receptor β (TCRβ) repertoire in the CP and control groups. TCRβ sequencing revealed a significant increase in TCRβ repertoire diversity and reduced clonality in both CP groups versus controls. Interestingly, we observed differences in Vβ-Jβ gene family usage between hereditary and idiopathic CP and a positive correlation of TCRβ rearrangements with disease severity scores. Immunophenotyping analyses in hereditary and idiopathic CP pancreases indicate differences in innate and adaptive immune responses, which highlights differences in immunopathogenic mechanisms of disease among subtypes of CP. TCR repertoire analysis further suggests a role for specific T cell responses in hereditary versus idiopathic CP pathogenesis, providing insights into immune responses associated with human CP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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