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Enregistrement W3006119088 · doi:10.1016/j.csbj.2020.02.003

The bioenergetics of integrin-based adhesion, from single molecule dynamics to stability of macromolecular complexes

2020· review· en· W3006119088 sur OpenAlexafffund
L. A. MacKay, Anmar Khadra

Notice bibliographique

RevueComputational and Structural Biotechnology Journal · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésIntegrinAdhesionBiophysicsCell adhesionChemistryCell biologyDynamics (music)CytoskeletonActin cytoskeletonFocal adhesionActinNanotechnologyCytoplasmBiologyReceptorCellMaterials scienceSignal transductionBiochemistryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The forces actively generated by motile cells must be transmitted to their environment in a spatiotemporally regulated manner, in order to produce directional cellular motion. This task is accomplished through integrin-based adhesions, large macromolecular complexes that link the actin-cytoskelton inside the cell to its external environment. Despite their relatively large size, adhesions exhibit rapid dynamics, switching between assembly and disassembly in response to chemical and mechanical cues exerted by cytoplasmic biochemical signals, and intracellular/extracellular forces, respectively. While in material science, force typically disrupts adhesive contact, in this biological system, force has a more nuanced effect, capable of causing assembly or disassembly. This initially puzzled experimentalists and theorists alike, but investigation into the mechanisms regulating adhesion dynamics have progressively elucidated the origin of these phenomena. This review provides an overview of recent studies focused on the theoretical understanding of adhesion assembly and disassembly as well as the experimental studies that motivated them. We first concentrate on the kinetics of integrin receptors, which exhibit a complex response to force, and then investigate how this response manifests itself in macromolecular adhesion complexes. We then turn our attention to studies of adhesion plaque dynamics that link integrins to the actin-cytoskeleton, and explain how force can influence the assembly/disassembly of these macromolecular structure. Subsequently, we analyze the effect of force on integrins populations across lengthscales larger than single adhesions. Finally, we cover some theoretical studies that have considered both integrins and the adhesion plaque and discuss some potential future avenues of research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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