A revolutionary protocol to describe understudied hyperdiverse taxa and overcome the taxonomic impediment
Notice bibliographique
Résumé
Here we elucidate and justify a DNA barcode approach to insect species description that can be applied to name tens of thousands of species of Ichneumonoidea and many other species-rich taxa. Each description consists of a lateral habitus image of the specimen, a COI barcode diagnosis, and the holotype specimen information required by the International Code of Zoological Nomenclature. We believe this approach, or a slight modification of it, will be useful for many other underdescribed hyperdiverse taxa, especially in the tropics. Due to the extreme species-richness of the Ichneumonoidea, the very low percentage of described species, and the lack of detailed biological information for most described species, the standard taxonomic approach is inefficient and overwhelmingly time consuming. A DNA barcode-based approach to initial description will provide a solid foundation of species hypotheses from which more comprehensive descriptions can be developed as other data, time, and budgets permit. Here we elucidate this view and detailed methodology that can generally be applied to species-rich underdescribed taxa. A real example is given by describing species in two genera, Hemichoma and Zelomorpha , reared from the Área de Conservación Guanacaste in northwestern Costa Rica. The generic type species Zelomorphaarizonensis is given a DNA barcode diagnosis and the following new species are described: Zelomorphaangelsolisi , Zelomorphabobandersoni , Zelomorphadanjohnsoni , Zelomorphadonwindsori , Zelomorphaeffugia , Zelomorphajohnchemsaki , Zelomorphakellyanneae , Zelomorphalarrykirkendalli , Zelomorphamariyavladmirovnae , Zelomorphamikeiviei , Zelomorphamyricagaleae , Zelomorphanoahjaneae , Zelomorphapaulgoldsteini , Zelomorphaterryerwini , Zelomorphawillsflowersi , Hemichomadonwhiteheadi , Hemichomafrankhovorei , and Hemichomajohnkingsolveri .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,019 | 0,019 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».