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Enregistrement W3006145769 · doi:10.3897/dez.66.34683

A revolutionary protocol to describe understudied hyperdiverse taxa and overcome the taxonomic impediment

2019· article· en· W3006145769 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueDeutsche Entomologische Zeitschrift · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHymenoptera taxonomy and phylogeny
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésBarcodeTaxonDNA barcodingBiologyHolotypeInternational Code of Zoological NomenclatureTaxonomic rankSpecies richnessEvolutionary biologyZoologyEcologyTaxonomy (biology)NomenclatureComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Here we elucidate and justify a DNA barcode approach to insect species description that can be applied to name tens of thousands of species of Ichneumonoidea and many other species-rich taxa. Each description consists of a lateral habitus image of the specimen, a COI barcode diagnosis, and the holotype specimen information required by the International Code of Zoological Nomenclature. We believe this approach, or a slight modification of it, will be useful for many other underdescribed hyperdiverse taxa, especially in the tropics. Due to the extreme species-richness of the Ichneumonoidea, the very low percentage of described species, and the lack of detailed biological information for most described species, the standard taxonomic approach is inefficient and overwhelmingly time consuming. A DNA barcode-based approach to initial description will provide a solid foundation of species hypotheses from which more comprehensive descriptions can be developed as other data, time, and budgets permit. Here we elucidate this view and detailed methodology that can generally be applied to species-rich underdescribed taxa. A real example is given by describing species in two genera, Hemichoma and Zelomorpha , reared from the Área de Conservación Guanacaste in northwestern Costa Rica. The generic type species Zelomorphaarizonensis is given a DNA barcode diagnosis and the following new species are described: Zelomorphaangelsolisi , Zelomorphabobandersoni , Zelomorphadanjohnsoni , Zelomorphadonwindsori , Zelomorphaeffugia , Zelomorphajohnchemsaki , Zelomorphakellyanneae , Zelomorphalarrykirkendalli , Zelomorphamariyavladmirovnae , Zelomorphamikeiviei , Zelomorphamyricagaleae , Zelomorphanoahjaneae , Zelomorphapaulgoldsteini , Zelomorphaterryerwini , Zelomorphawillsflowersi , Hemichomadonwhiteheadi , Hemichomafrankhovorei , and Hemichomajohnkingsolveri .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,773
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle