MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3006195141 · doi:10.1681/asn.2019090889

Authors’ Reply

2019· letter· en· W3006195141 sur OpenAlexaff
Germaine Wong, Richard L. Hope, Kirsten Howard, Jeremy R. Chapman, Antoni Castells, Simon D. Roger, Michael J. Bourke, Petra Macaskill, Robin Turner, Gabrielle Williams, Wai H. Lim, Charmaine E. Lok, Fritz Diekman, Nicholas C.P. Cross, Shaundeep Sen, Richard D. Allen, Steven J. Chadban, Carol A. Pollock, Allison Tong, Armando Teixeira‐Pinto, Jean Yang, Narelle Williams, Eric Au, Anh Kieu, Laura James, Jonathan C. Craig

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2019
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Screening and Detection
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineColonoscopyTest (biology)Colorectal cancer screeningColorectal cancerPopulationGold standard (test)Internal medicineGastroenterologySurgeryCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We appreciate the interest shown by Collins et al.1 in our study of screening advanced colorectal neoplasia in people with CKD (DETECT). They assert that the performance characteristics of fecal immunochemical testing (FIT) arising from our study are unreliable because of verification bias and that high false positive rates were found due to low test thresholds.1 We note that the authors have conducted a similar study but found lower test-positive and sensitivity values.2 The observed differences in the test estimates are not unexpected. Their study was conducted in a single center, restricted only to transplant recipients, and of smaller sample size. A quantitative FIT (Eiken OC-Sensor) was the chosen screening tool for DETECT, because it is the screening test of choice by the National Bowel Cancer Screening program in Australia and Spain, rather than the InSure FIT (brush techniques) used by Collins et al.1 Prior studies have also indicated lower positivity rates and sensitivity estimates for advanced colorectal neoplasia with the InSure FIT compared with the Eiken OC-Sensor FIT in the general population.3,4 We suggest that the two-step reference standard (colonoscopy for FIT-positive patients and clinical follow-up for both FIT-positive and FIT-negative patients) is in fact the correct one and not colonoscopy for all for three reasons. First, given the appreciable risk of colonoscopy in potentially high-risk patients, we could not ethically justify subjecting FIT-negative patients to an unnecessary procedure. Second, what Collins et al.1 have not considered is the potential for overdiagnosis. We acknowledge that this has only been recognized as a major issue recently, postdating their publication in 2012. Overdiagnosis occurs when the disease detected through screening does not cause morbidity and/or death.5 This is an important concept to consider, particularly in patients with limited life expectancy, such as those with CKD, and when competing events, such as cardiovascular diseases, predominate as the major cause of death. Overdiagnosis, the downside of cancer screening, will trigger a sequence of overtreatment, with the attendant adverse events and without benefit, because the screened individual will never experience the health consequences of the target condition. We anticipated that the harms associated with diagnostic colonoscopies are likely to be higher among those with CKD and thus, limit the benefits of routine screening. Our findings confirmed that colonoscopies and subsequent treatments, including polypectomy, incurred at least a 10-fold increased risk of major complications, including perforations and infections, in patients with CKD compared with those reported in the general population. Third, our two-step process is clinically feasible and allows for external generalizability. In our study, a follow-up of 2 years was chosen to ensure that all clinically relevant colorectal cancers had enough time to progress to a detectable stage and that new (interval) cancers that develop after the index test (FIT) were also being detected. Importantly, only 14 additional patients (0.9%) were diagnosed with advanced colorectal neoplasia at the end of the 2-year follow-up, indicating that, even if differential verification bias may exist in theory, it is unlikely to be clinically relevant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,109
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,115

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,109
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0050,006
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0240,033
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0340,022

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Society of NephrologyMême sujetColorectal Cancer Screening and DetectionTravaux en français237 207