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Enregistrement W3006239481 · doi:10.1038/s41587-020-0448-9

Publisher Correction: Butler enables rapid cloud-based analysis of thousands of human genomes

2020· erratum· en· W3006239481 sur OpenAlexaff
Sebastian M. Waszak, Brice Aminou, Javier Bartolome, Keith A. Boroevich, Rich Boyce, Angela N. Brooks, Alex Buchanan, Ivo Buchhalter, Adam P. Butler, Niall J. Byrne, Andy Cafferkey, Peter J. Campbell, Zhaohong Chen, Sunghoon Cho, Wan Choi, Peter Clapham, Brandi N. Davis‐Dusenbery, Francisco M. De La Vega, Jonas Demeulemeester, Michelle T. Dow, Lewis Jonathan Dursi, Roland Eils, Kyle Ellrott, Claudiu Farcas, Francesco Favero, Nodirjon Fayzullaev, Vincent Ferretti, Paul Flicek, Nuno A. Fonseca, Josep Lluis Gelpí, Gad Getz, Bob Gibson, Robert L. Grossman, Olivier Harismendy, Allison P. Heath, Michael C. Heinold, Julian M. Hess, Oliver Hofmann, Jongwhi H. Hong, Thomas J. Hudson, Barbara Hutter, Carolyn M. Hutter, Daniel Hübschmann, Seiya Imoto, Sinisa Ivkovic, Seung-Hyup Jeon, Wei Jiao, Jongsun Jung, Rolf Kabbe, André Kahles, Jules N. A. Kerssemakers, Hyung‐Lae Kim, Hyunghwan Kim, Jihoon Kim, Young-Wook Kim, Kortine Kleinheinz, Michael Koscher, Antonios Koures, Milena Kovacevic, Chris Lawerenz, Ignaty Leshchiner, Jia Liu, Dimitri Livitz, George L. Mihaiescu, Sanja Mijalković, Ana Mijalkovic Lazic, Satoru Miyano, Naoki Miyoshi, Hardeep K. Nahal-Bose, Hidewaki Nakagawa, Mia Nastic, Steven Newhouse, Jonathan Nicholson, Brian D. O’Connor, David Ocaña, Kazuhiro Ohi, Lucila Ohno‐Machado, Larsson Omberg, B. F. Francis Ouellette, Nagarajan Paramasivam, Marc D. Perry, Todd Pihl, Manuel Prinz, Montserrat Puiggròs, Petar Radovic, Keiran Raine, Esther Rheinbay, Mara Rosenberg, Romina Royo, Gunnar Rätsch, Gordon Saksena, Matthias Schlesner, Solomon I. Shorser, Charles Short, Heidi J. Sofia, Jonathan Spring, Lincoln Stein, Adam J. Struck, Grace Tiao, Nebojša Tijanić, David Torrents, Peter Van Loo, Miguél Vázquez, David Vicente, Jeremiah A. Wala, Zhining Wang, Joachim Weischenfeldt, Johannes Werner, Ashley Williams, Youngchoon Woo, A. Jordan Wright, Qian Xiang, Liming Yang, Denis Yuen, Christina K. Yung, Junjun Zhang, Jan O. Korbel, Michael Gertz

Notice bibliographique

RevueNature Biotechnology · 2020
Typeerratum
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Bioinformatics, and Biomedical Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesEuropean Research CouncilEuropean CommissionEuropean Molecular Biology Organization
Mots-clésCloud computingComputational biologyComputer scienceGenomeData scienceBiologyGeneticsGeneOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An amendment to this paper has been published and can be accessed via a link at the top of the paper.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,058
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,099
Score d'incertitude au seuil0,332

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,058
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0040,002
Communication savante0,0060,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0040,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0990,074

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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Résumé présentoui

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