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Enregistrement W3006396558 · doi:10.1002/sim.8495

A hierarchical testing approach for detecting safety signals in clinical trials

2020· article· en· W3006396558 sur OpenAlexafffund
Xianming Tan, Bingshu E. Chen, Jianping Sun, Tejendra Patel, Joseph G. Ibrahim

Notice bibliographique

RevueStatistics in Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésComputer scienceClinical trialData miningSafety monitoringCurse of dimensionalityClass (philosophy)Artificial intelligenceMedicineBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Detecting safety signals in clinical trial safety data is known to be challenging due to high dimensionality, rare occurrence, weak signal, and complex dependence. We propose a new hierarchical testing approach for analyzing safety data from a typical randomized clinical trial. This approach accounts for the hierarchical structure of adverse events (AEs), that is, AEs are categorized by system organ class (SOC). Our approach contains two steps: the first step tests, for each SOC, whether any AEs within this SOC are differently distributed between treatment arms; and the second step identifies signal AEs from SOCs passing the first step tests. We show the superiority, in terms of power of detecting safety signals given controlled false discovery rate, of the new approach comparing with currently available approaches through simulation studies. We also demonstrate this approach with two real data examples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,070
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,172
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,930
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0700,172
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,830
Tête enseignante GPT0,650
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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