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Enregistrement W3006403960 · doi:10.3389/fgene.2020.00028

In Situ Genetic Evaluation of European Larch Across Climatic Regions Using Marker-Based Pedigree Reconstruction

2020· article· en· W3006403960 sur OpenAlexaff
Milan Lstibůrek, Silvio Schueler, Yousry A. El‐Kassaby, Gary R. Hodge, Jan Stejskal, Jičí Korecký, Petr Škorpík, Heino Konrad, Thomas Geburek

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest ecology and management
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReforestationTree breedingLarchForest managementRange (aeronautics)BiodiversityProductivityClimate changeAgroforestryEcologyEnvironmental resource managementAfforestationAdaptation (eye)GeographyEnvironmental scienceBiologyWoody plant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sustainable and efficient forestry in a rapidly changing climate is a daunting task. The sessile nature of trees makes adaptation to climate change challenging; thereby ecological services and economic potential are under risk. Current long-term and costly gene resources management practices have been primarily directed at few economically important species, and are confined to defined ecological boundaries. Here we present a novel in situ gene-resource management approach that conserves forest biodiversity and improves productivity and adaptation through utilizing basic forest regeneration installations located across a wide range of environments without the reliance on structured tree breeding/conservation methods. We utilized 4,267 25- to 35-year-old European larch trees growing on 21 reforestation installations across four distinct climatic regions in Austria. With the aid of marker-based pedigree reconstruction, we applied multi-trait, multi-site quantitative genetic analyses that enabled the identification of broadly adapted and productive individuals. Height and wood density, proxies to fitness and productivity, yielded in situ heritability estimates of 0.23±0.065 and 0.30±0.073, values similar to those from traditional “structured” pedigrees methods. In addition, individual trees selected with this approach are expected to yield genetic response of 1.1 and 0.7 standard deviations for fitness and productivity attributes, respectively, and be broadly adapted to a range of climatic conditions. Genetic evaluation across broad climatic gradients permitted delineation of suitable reforestation areas under current and future climates. This simple and resource-efficient management of gene resources is applicable to most tree species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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