Sphingolipids regulate the tethering stage of vacuole fusion by affecting membrane fluidity
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Sphingolipids are essential in membrane trafficking and cellular homeostasis. Here, we show that sphingolipids containing very long-chain fatty acids (VLCFAs) promote robust homotypic vacuolar fusion in Saccharomyces cerevisiae . The elongase Elo3 adds two carbons to 24-carbon (C24) acyl chains to make C26 VLCFAs that are incorporated into sphingolipids. Vacuoles isolated from elo3 Δ cells had increased fluidity relative to the wild-type and were attenuated for fusion. Upon further testing we found that vesicle the tethering stage was affected as elo3 Δ vacuole clusters contained fewer vesicles versus the WT. Vacuole tethering requires the interactions of late endosomal Rab GTPase Ypt7 and the HOPS tethering complex. Pulldown assays using GST-Ypt7 showed that HOPS from elo3 Δ vacuole extracts failed to bind Ypt7 while HOPS from WT extracts interacted with GST-Ypt7. Furthermore GFP-Ypt7 failed to localize at vertex microdomains of elo3 Δ vacuoles relative to the WT, whereas HOPS and regulatory lipids did accumulate at vertices. Finally, we found that elo3 Δ vacuoles had reduced V-ATPase. Together these data show that C26-VLCFA containing sphingolipids are important for Ytp7 function and vacuole homeostasis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».