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Enregistrement W3006663041 · doi:10.1002/csc2.20124

Downregulation of key genes involved in carbon metabolism in <i>Medicago truncatula</i> results in increased lipid accumulation in vegetative tissue

2020· article· en· W3006663041 sur OpenAlexafffund
Champa Wijekoon, Stacy D. Singer, Randall J. Weselake, James R. Petrie, Guanqun Chen, Surinder Singh, Peter J. Eastmond, S. N. Acharya

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of AlbertaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilAgriculture and Agri-Food CanadaCanada Research ChairsAlberta Beef Producers
Mots-clésBiologyMedicago truncatulaShootBotanyMedicagoLipid metabolismBiochemistryGeneSymbiosisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Alfalfa ( Medicago sativa L.) is the most widely grown perennial forage crop and is a close relative of the model diploid legume Medicago truncatula Gaertn. However, use of alfalfa leads to substantial greenhouse gas emissions and economic losses related to inefficiencies in rumen fermentation. The provision of supplemental lipids has been used as a strategy to mitigate these issues, but it is a costly approach. The ability to enhance lipid content within the vegetative tissues of alfalfa would therefore be very advantageous. As such, our aim was to assess and select gene candidates to increase total shoot lipid content in M. truncatula using a virus‐induced gene silencing (VIGS) approach. We targeted gene homologs of the SUGAR‐DEPENDANT 1 ( SDP1 ), ADP‐GLUCOSE‐PYROPHOSPHORYLASE SMALL SUBUNIT 1 ( APS1 ), TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 5 ( TGD5 ), and PEROXISOMAL ABC TRANSPORTER 1 ( PXA1) in M. truncatula for silencing. Reduced target transcript levels were confirmed and changes of shoot lipid content and fatty acid composition were measured. Silencing of SDP1, APS1 , and PXA1 each resulted in significant increases in shoot total lipid content. Significantly increased proportions of α‐linolenic acid (18:3Δ 9 cis ,12 cis ,15 cis ) were observed, and stearic acid (18:0) levels significantly decreased in the total acyl lipids extracted from vegetative tissues of each of the M. truncatula silenced plants. In contrast, palmitic acid (16:0) levels were significantly decreased in only SDP1‐ and PXA1 ‐silenced plants. Genes of PXA1 and SDP1 would be ideal targets for mutation as a means of improving the quality of alfalfa to increase feed efficiency and minimize greenhouse gas emissions from livestock production in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,350
Score d'incertitude au seuil0,542

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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