MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3006952499 · doi:10.1101/2020.02.24.956631

Partitioning the colonization and extinction components of beta diversity: Spatiotemporal species turnover across disturbance gradients

2020· preprint· en· W3006952499 sur OpenAlexaff
Shinichi Tatsumi, Joachim Strengbom, Mihails Čugunovs, Jari Kouki

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEcology and Vegetation Dynamics Studies
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceMaj ja Tor Nesslingin Säätiö
Mots-clésColonizationExtinction (optical mineralogy)Beta diversityDisturbance (geology)EcologyGamma diversityIntermediate Disturbance HypothesisSpecies diversityBiologyDiversity (politics)Local extinctionBiodiversityBiological dispersalDemographyPopulationPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Changes in species diversity often result from species losses and gains. The dynamic nature of beta diversity (i.e., spatial variation in species composition) that derives from such temporal species turnover, however, has been largely overlooked. Here, we disentangled extinction and colonization components of beta diversity by using the sets of species that went locally extinct and that newly colonized the given sites. We applied this concept of extinction and colonization beta diversity to plant communities that have been repeatedly measured in experimentally disturbed forests. We first found no difference in beta diversity across disturbance gradients when it was analyzed for communities at a single point in time. From this result, we might conclude that disturbance caused no impact on how species assemble across space. However, when we analyzed the extinction and colonization beta diversity, both measures were found to be significantly lower in disturbed sites compared to undisturbed sites. These results indicate that disturbance removed similar subsets of species across space, making communities differentiate, but at the same time induced spatially uniform colonization of new species, causing communities to homogenize. Consequently, the effects of these two processes canceled each other out. The relative importance of extinction and colonization components per se also changed temporally after disturbance. Analyses using extinction and colonization beta diversity allowed us to detect nonrandom dis- and re-assembly dynamics in plant communities. Our results suggest that common practices of analyzing beta diversity at one point in time can mask significant variation driven by disturbance. Acknowledging the extinction–colonization dynamics behind beta diversity is essential for understanding the spatiotemporal organization of biodiversity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetEcology and Vegetation Dynamics Studies→Travaux en français237 207→