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Enregistrement W3007006547 · doi:10.1681/asn.2019080825

Ultrastructural Characterization of Proteinuric Patients Predicts Clinical Outcomes

2020· article· en· W3007006547 sur OpenAlexaff
Virginie Royal, Jarcy Zee, Qian Liu, Carmen Ávila-Casado, Abigail R. Smith, Gang Liu, Laura H. Mariani, Stephen M. Hewitt, Lawrence B. Holzman, Brenda W. Gillespie, Jeffrey B. Hodgin, Laura Barisoni

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of TorontoUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesHalpin FoundationNational Center for Advancing Translational SciencesUniversity of MichiganNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNephcure Foundation
Mots-clésUltrastructureMedicineKidney diseaseInternal medicinePathologyUrology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Statement Glomerular features ascertained by electron microscopy are underreported in clinical practice, and their value in predicting outcome is unclear. This study is the first comprehensive investigation of the association of clinical outcomes with 12 glomerular electron microscopy descriptors reflecting the status of podocytes, endothelial cells, and glomerular basement membranes, individually and as electron microscopy profiles after descriptor-based consensus clustering. The authors demonstrate that severe effacement and microvillous transformation, individually and as a component of clusters, were associated with proteinuria remission, whereas prominent endothelial cell and glomerular basement membrane abnormalities were associated with loss of renal function. These findings highlight the importance of a standardized and comprehensive ultrastructural analysis, and that use of quantifiable structural changes in assessing patients with proteinuria might have important clinical implications. Background The analysis and reporting of glomerular features ascertained by electron microscopy are limited to few parameters with minimal predictive value, despite some contributions to disease diagnoses. Methods We investigated the prognostic value of 12 electron microscopy histologic and ultrastructural changes (descriptors) from the Nephrotic Syndrome Study Network (NEPTUNE) Digital Pathology Scoring System. Study pathologists scored 12 descriptors in NEPTUNE renal biopsies from 242 patients with minimal change disease or FSGS, with duplicate readings to evaluate reproducibility. We performed consensus clustering of patients to identify unique electron microscopy profiles. For both individual descriptors and clusters, we used Cox regression models to assess associations with time from biopsy to proteinuria remission and time to a composite progression outcome (≥40% decline in eGFR, with eGFR<60 ml/min per 1.73 m 2 , or ESKD), and linear mixed models for longitudinal eGFR measures. Results Intrarater and interrater reproducibility was >0.60 for 12 out of 12 and seven out of 12 descriptors, respectively. Individual podocyte descriptors such as effacement and microvillous transformation were associated with complete remission, whereas endothelial cell and glomerular basement membrane abnormalities were associated with progression. We identified six descriptor-based clusters with distinct electron microscopy profiles and clinical outcomes. Patients in a cluster with more prominent foot process effacement and microvillous transformation had the highest rates of complete proteinuria remission, whereas patients in clusters with extensive loss of primary processes and endothelial cell damage had the highest rates of the composite progression outcome. Conclusions Systematic analysis of electron microscopic findings reveals clusters of findings associated with either proteinuria remission or disease progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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