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Enregistrement W3007049734 · doi:10.7554/elife.53385

NeuroQuery, comprehensive meta-analysis of human brain mapping

2020· preprint· en· W3007049734 sur OpenAlexafffund
Jérôme Dockès, Russell A. Poldrack, Romain Primet, Hande Gözükan, Tal Yarkoni, Fabian M. Suchanek, Bertrand Thirion, Gaël Varoquaux

Notice bibliographique

RevueeLife · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthEuropean CommissionMcGill UniversityH2020 European Research CouncilCanada First Research Excellence FundAgence Nationale de la RechercheNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésNeuroimagingTerminologyInferenceComputer sciencePrior probabilityData scienceArtificial intelligenceVariety (cybernetics)Cognitive scienceBayesian probabilityPsychologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Reaching a global view of brain organization requires assembling evidence on widely different mental processes and mechanisms. The variety of human neuroscience concepts and terminology poses a fundamental challenge to relating brain imaging results across the scientific literature. Existing meta-analysis methods perform statistical tests on sets of publications associated with a particular concept. Thus, large-scale meta-analyses only tackle single terms that occur frequently. We propose a new paradigm, focusing on prediction rather than inference. Our multivariate model predicts the spatial distribution of neurological observations, given text describing an experiment, cognitive process, or disease. This approach handles text of arbitrary length and terms that are too rare for standard meta-analysis. We capture the relationships and neural correlates of 7547 neuroscience terms across 13 459 neuroimaging publications. The resulting meta-analytic tool, neuroquery.org, can ground hypothesis generation and data-analysis priors on a comprehensive view of published findings on the brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,037
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,153
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,196

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0370,153
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,017
Bibliométrie0,0120,014
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0040,006
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0280,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,346
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,017 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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