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Enregistrement W3007112494 · doi:10.1002/jbio.201960243

Efficient and cost‐effective 3D cellular imaging by sub‐voxel‐resolving light‐sheet add‐on microscopy

2020· article· en· W3007112494 sur OpenAlexaff
Fang Zhao, Yicong Yang, Yi Li, Hao Jiang, Xinlin Xie, Tingting Yu, Xuechun Wang, Qing Liu, Hao Zhang, Haibo Jia, Sheng Liu, Mei Zhen, Dan Zhu, Shangbang Gao, Peng Fei

Notice bibliographique

RevueJournal of Biophotonics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNatural Science Foundation of Hubei ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésLight sheet fluorescence microscopyVoxelMicroscopyMicroscopeFluorescence microscopeOpticsMaterials scienceOptical microscopeComputer scienceComputer visionFluorescenceScanning confocal electron microscopyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Light-sheet fluorescence microscopy (LSFM) allows volumetric live imaging at high-speed and with low photo-toxicity. Various LSFM modalities are commercially available, but their size and cost limit their access by the research community. A new method, termed sub-voxel-resolving (SVR) light-sheet add-on microscopy (SLAM), is presented to enable fast, resolution-enhanced light-sheet fluorescence imaging from a conventional wide-field microscope. This method contains two components: a miniature add-on device to regular wide-field microscopes, which contains a horizontal laser light-sheet illumination path to confine fluorophore excitation at the vicinity of the focal plane for optical sectioning; an off-axis scanning strategy and a SVR algorithm that utilizes sub-voxel spatial shifts to reconstruct the image volume that results in a twofold increase in resolution. SLAM method has been applied to observe the muscle activity change of crawling C. elegans, the heartbeat of developing zebrafish embryo, and the neural anatomy of cleared mouse brains, at high spatiotemporal resolution. It provides an efficient and cost-effective solution to convert the vast number of in-service microscopes for fast 3D live imaging with voxel-super-resolved capability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,886

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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