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Enregistrement W3007170690 · doi:10.1002/ana.25709

Robust Markers and Sample Sizes for Multicenter Trials of Huntington Disease

2020· article· en· W3007170690 sur OpenAlexfundno aff
P. A. Wijeratne, Eileanoir B. Johnson, Arman Eshaghi, Leon Aksman, Sarah Gregory, Hans J. Johnson, Govinda Poudel, Amrita Mohan, Cristina Sampaio, Nellie Georgiou‐Karistianis, Jane S. Paulsen, Sarah J. Tabrizi, Rachael I. Scahill

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMedical Research CouncilNational Health and Medical Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeMedical Research Council CanadaEuropean CommissionCHDI FoundationUniversity College LondonWellcome TrustEngineering and Physical Sciences Research Council
Mots-clésSample size determinationMagnetic resonance imagingWhite matterNeuroimagingClinical trialStatistical powerMedicineHuntington's diseaseNuclear medicinePathologyDiseaseRadiologyStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: The identification of sensitive biomarkers is essential to validate therapeutics for Huntington disease (HD). We directly compare structural imaging markers across the largest collective imaging HD dataset to identify a set of imaging markers robust to multicenter variation and to derive upper estimates on sample sizes for clinical trials in HD. METHODS: We used 1 postprocessing pipeline to retrospectively analyze T1-weighted magnetic resonance imaging (MRI) scans from 624 participants at 3 time points, from the PREDICT-HD, TRACK-HD, and IMAGE-HD studies. We used mixed effects models to adjust regional brain volumes for covariates, calculate effect sizes, and simulate possible treatment effects in disease-affected anatomical regions. We used our model to estimate the statistical power of possible treatment effects for anatomical regions and clinical markers. RESULTS: We identified a set of common anatomical regions that have similarly large standardized effect sizes (>0.5) between healthy control and premanifest HD (PreHD) groups. These included subcortical, white matter, and cortical regions and nonventricular cerebrospinal fluid (CSF). We also observed a consistent spatial distribution of effect size by region across the whole brain. We found that multicenter studies were necessary to capture treatment effect variance; for a 20% treatment effect, power of >80% was achieved for the caudate (n = 661), pallidum (n = 687), and nonventricular CSF (n = 939), and, crucially, these imaging markers provided greater power than standard clinical markers. INTERPRETATION: Our findings provide the first cross-study validation of structural imaging markers in HD, supporting the use of these measurements as endpoints for both observational studies and clinical trials. ANN NEUROL 2020;87:751-762.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,315
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,584
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,315
Score d'incertitude au seuil0,844

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3150,584
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,006
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,244
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,113 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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