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Enregistrement W3007192719 · doi:10.1093/jcag/gwz047.039

A40 INTESTINAL EPITHELIAL NCOR1 TARGETS TRYPTOPHAN METABOLISM AND PROTECTS AGAINST EXPERIMENTAL COLITIS

2020· article· en· W3007192719 sur OpenAlexaff
Mia Lecours, A Di Castro, V Reyes-Nicolas, Stéphanie St‐Jean, A Loiselle, Christine M. Jones, Nathalie Perreault, François Boudreau

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMacrophage Migration Inhibitory Factor
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCancer researchIntestinal epitheliumCell biologyGeneticsEpithelium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The nuclear co-repressor NCOR1 is a central protein that orchestrates the assembly of a large transcriptional repression complex. NCOR1 controls activation of macrophages by repressing a large variety of pro-inflammatory genes. Aims We aimed to investigate the role of intestinal epithelial NCOR1 during experimental colitis. Methods Conditional deletion of Ncor1 in the whole intestinal epithelium was achieved by crossing Villin-Cre and Ncor1loxP/loxP C57BL/6 mouse models. A gene profiling analysis in the colon of non-diseased NCOR1ΔIEC and control mice was performed. NCOR1ΔIEC and control littermate mice were treated with dextran sulfate sodium (DSS) in drinking water. Results DSS-induced colitis in NCOR1ΔIEC mice was more severe than control mice according to survival as well as clinical observations. A statistical analysis predicted 85 unique and mapped transcripts being significantly modulated between NCOR1ΔIEC and control mice. An Ingenuity Pathway Analysis from these predicted target genes identified gastrointestinal disease (79 transcripts) as top disease and biofunction. Analysis of enriched targets in specific canonical pathways predicted an increase in the tryptophan degradation pathway (P = 3.2E-02), a pathway recently demonstrated to be strongly relevant to inflammatory bowel disease severity. Indoleamine-pyrrole 2,3-dioxygenase (IDO1), that catalyzes the first and rate-limiting step of tryptophan oxidation, was induced more than 7 times in the colon of NCOR1ΔIEC mice. Induction of Ido1 was also confirmed in cultured ex vivo colon organoids deleted for Ncor1. Conclusions Our results highlight the critical role of NCOR1 to maintain intestinal inflammatory homeostasis during experimental colitis and uncover a novel function for NCOR1 in the regulation of Ido1 expression and potentially tryptophan metabolism. Funding Agencies CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,331
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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