Development of a composite biomarker-based calculator to predict the probability of pathologic complete response (pT0) after neoadjuvant pembrolizumab (pembro) in muscle invasive bladder cancer (MIBC).
Notice bibliographique
Résumé
539 Background: The PURE01 study (NCT02736266) evaluates the use of pembro before radical cystectomy (RC) in MIBC. We assessed selected individual and combined biomarkers for predicting pT0 response after pembro, and developed a tool that may be used as an aid for clinical decision-making. Methods: Patients (pts) enrolled in the PURE01 were clinical (c) stage T≤4aN0M0 MIBC. Analysis to date included a comprehensive genomic profiling (FoundationONE assay), programmed cell-death-ligand-1 (PD-L1) combined positive score assessment (CPS, Dako 22C3 antibody) and whole transcriptome (Decipher assay) and RNA-seq profiling of pre/post therapy samples. Multivariable logistic regression analyses (MVA) evaluated baseline cT-stage and biomarkers in association with pT0 response. Corresponding coefficients were used to develop a risk calculator based on the tumor mutational burden (TMB), CPS, Immune190 signature score, and cT-stage. Decision-curve analysis was performed. Results: Complete biomarker data was available for 84 pts. Increasing TMB, CPS, and Immune190 scores showed a linear positive correlation with the pT0 probability in logistic regression (p=0.02, p=0.004, p=0.02). The c-index of the risk calculator was 0.79. Decision-curve analysis found the net-benefit of the model was higher than the “treat-all” option within the clinically-meaningful threshold probabilities of achieving a pT0 of 40-60%. Within this range, adding the Immune190 score improved the model over TMB and CPS. A significant decrease in median TMB values was observed (p=0.005) in 24 matched RC, versus a non-significant change in median CPS in 38 matched RC. Molecular subtyping switching was observed in 20/31 matched cases (64.5%), most frequently to the luminal-infiltrated subtype (80%). Conclusions: The study presents the first composite biomarker-based pT0 probability calculator for optimal pt selection. Pending validation, the model may be used to recommend neoadjuvant pembro to very selected MIBC pts. The observed changes in biomarker features in post-therapy samples may have an impact on future adjuvant strategies. Clinical trial information: NCT02736266.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».