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Enregistrement W3007310588 · doi:10.1021/jacs.9b13077

Disparity of Cytochrome Utilization in Anodic and Cathodic Extracellular Electron Transfer Pathways of <i>Geobacter sulfurreducens</i> Biofilms

2020· article· en· W3007310588 sur OpenAlexaff
Nina Heidary, Nikolay Kornienko, Shafeer Kalathil, Xin Fang, Khoa H. Ly, Heather F. Greer, Erwin Reisner

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Fuel Cells and Bioremediation
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsH2020 European Research CouncilEngineering and Physical Sciences Research CouncilTechnische Universität DresdenRoyal Society
Mots-clésGeobacter sulfurreducensChemistryBiofilmElectron transferCathodic protectionGeobacterAnodeExtracellularCytochromeElectron transport chainCytochrome cBiochemistryBacteriaElectrodePhotochemistryEnzymeMitochondrionPhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Extracellular electron transfer (EET) in microorganisms is prevalent in nature and has been utilized in functional bioelectrochemical systems. EET of Geobacter sulfurreducens has been extensively studied and has been revealed to be facilitated through c-type cytochromes, which mediate charge between the electrode and G. sulfurreducens in anodic mode. However, the EET pathway of cathodic conversion of fumarate to succinate is still under debate. Here, we apply a variety of analytical methods, including electrochemistry, UV–vis absorption and resonance Raman spectroscopy, quartz crystal microbalance with dissipation, and electron microscopy, to understand the involvement of cytochromes and other possible electron-mediating species in the switching between anodic and cathodic reaction modes. By switching the applied bias for a G. sulfurreducens biofilm coupled to investigating the quantity and function of cytochromes, as well as the emergence of Fe-containing particles on the cell membrane, we provide evidence of a diminished role of cytochromes in cathodic EET. This work sheds light on the mechanisms of G. sulfurreducens biofilm growth and suggests the possible existence of a nonheme, iron-involving EET process in cathodic mode.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations103
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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