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Enregistrement W3007459937 · doi:10.1038/s41467-020-14518-3

A molecular gradient along the longitudinal axis of the human hippocampus informs large-scale behavioral systems

2020· article· en· W3007459937 sur OpenAlexafffund
Jacob W. Vogel, Renaud La Joie, Michel J. Grothe, Alexandr Diaz-Papkovich, Andrew Doyle, Étienne Vachon‐Presseau, Claude Lepage, Reinder Vos de Wael, Rhalena A. Thomas, Yasser Iturria‐Medina, Boris C. Bernhardt, Gil D. Rabinovici, Alan C. Evans

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueMemory and Neural Mechanisms
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill University and Génome Québec Innovation CentreMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesFonds de Recherche du Québec - SantéCentre d'Imagerie BioMédicaleNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchLudmer Centre for Neuroinformatics and Mental HealthNational Institute on AgingAlzheimer's AssociationAthinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging, Massachusetts General HospitalCentre Azrieli de recherche sur l'autisme, Institut et Hôpital Neurologiques de MontréalNational Institute of Mental HealthHospital for Sick ChildrenSavoy FoundationGovernment of CanadaMassachusetts General HospitalHarvard University
Mots-clésHippocampusHuman brainNeuroscienceBiologyCognitionPsychologyAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The functional organization of the hippocampus is distributed as a gradient along its longitudinal axis that explains its differential interaction with diverse brain systems. We show that the location of human tissue samples extracted along the longitudinal axis of the adult human hippocampus can be predicted within 2mm using the expression pattern of less than 100 genes. Futhermore, this model generalizes to an external set of tissue samples from prenatal human hippocampi. We examine variation in this specific gene expression pattern across the whole brain, finding a distinct anterioventral-posteriodorsal gradient. We find frontal and anterior temporal regions involved in social and motivational behaviors, and more functionally connected to the anterior hippocampus, to be clearly differentiated from posterior parieto-occipital regions involved in visuospatial cognition and more functionally connected to the posterior hippocampus. These findings place the human hippocampus at the interface of two major brain systems defined by a single molecular gradient.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations175
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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