Identification of <i>Salmonella</i> Serovars before and after Ultraviolet Light Irradiation by Fourier Transform Infrared (FT-IR) Spectroscopy and Chemometrics
Notice bibliographique
Résumé
Vibrational properties and structural behavior upon ultraviolet (UV) irradiation are reported here for DNAs isolated from three serovars of Salmonella bacteria, respectively (S. enteritidis, S. infantis and S. typhimurium) by using Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR). The FT-IR absorbance spectra were recorded for bacterial DNAs, control and UV irradiated samples (30 min, 1 h, 1 h 30 min), respectively, and are presented in the wavenumber ranges from 800 to 1800 cm−1 and from 3000 to 4000 cm−1, respectively. Molecular specific structural information has been found based on DNA marker bands, which were monitored primarily in terms of intensity changes. As a general remark, a serovar’s dependent nonlinear behavior has been detected for some FT-IR band intensities corresponding to Salmonella DNAs, as a function of irradiation time. Particularly, alterations in DNA functional groups and molecular geometry have been observed. Chemometric analysis such as principal component analysis (PCA) and hierarchical clustering analysis (HCA) were successfully applied for the identification of inter- and intra- serovar differences between DNA spectra, before and after UV irradiation. The elucidation of the main spectral features characteristic to pathogenic bacterial DNAs offers further opportunity for bacteria identification and for establishing the mechanisms of infections, leading to the development of innovative diagnosis tools and more effective therapies. Particularly, DNA-damaging agents are most effective in cancer therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».