Multiparametric magnetic resonance imaging of multifocal prostate cancer to reveal intra-prostatic genomic heterogeneity and novel radio-genomic correlates: Results of the Smarter Prostate Interventions and Therapeutics (SPIRIT) study.
Notice bibliographique
Résumé
20 Background: Multi-focality and heterogeneity in prostate cancer can confound the selection of appropriate clinical management. Our study aimed to explore radio-genomic correlations using multiparametric magnetic resonance imaging (mpMRI) against a histopathologic reference standard. Methods: Eight men with prostate cancer who underwent mpMRI followed by prostatectomy were selected for this pilot. Whole-mount histopathology was digitized and co-registered to corresponding MRI slices using a validated high-fidelity methodology.(1) Foci, including central/transitional and peripheral zone lesions were identified by a pathologist, and contoured on digitized histopathology specimens and these digitized maps were used to guide macrodissection of the individual foci for genomic copy-number aberration (CNA) analysis. Correlation of radiomics signatures with the histologic findings and genomic analysis was performed. Results: We found a broad range of CNAs revealing inter-patient and intra-prostatic heterogeneity. Recurrently-altered loci ( e.g., 8p21) containing genes of known significance ( e.g., NKX3-1) were observed. Only radiomic features derived from apparent diffusion coefficient (ADC) independently correlated with both Gleason grade (Rho=-0.62, p=0.003) and median CNA burden (Rho=-0.68, p<0.001). While greater CNA burden expectedly correlated with higher grade, intermediate-grade (Gleason score 3+4 or 4+3) lesions appeared more like either high-grade (Gleason scores ≥4+4) or low-grade (Gleason score 3+3) disease when clustered based on CNA and ADC metrics. Conclusions: These findings suggest ADC derived radiomic metrics may be a useful imaging biomarker across both central and peripheral zone lesion and could aid in further characterization of intra-prostatic biologic heterogeneity. These proof-of-principle data reveal novel radio-genomic correlations that could supplement histologic grading and conventional imaging, thus warranting expanded study and validation. 1) Int J Rad Oncol Biol Phys. 2016; 96(1):188-96.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».