A33 THE ROLE OF A HOMOZYGOUS PROTEIN CODING VARIANT OF EPS8 IN THE PATHOGENESIS OF PEDIATRIC IBD
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The rate of onset for Inflammatory Bowel Disease (IBD) is rising worldwide—most significantly in the pediatric population. The pathogenesis of the disease involves a complicated interaction between the environment and genetics. Recent findings suggest that there is a broad range of rare, single-gene mutations that correlate with the IBD phenotype in children. Some of these single-gene defects can disrupt the epithelial barrier, which alters intestinal immune homeostasis. Epidermal Growth Factor Receptor Kinase Substrate 8 (EPS8) is crucial for the stabilization of F-actin by capping and bundling the barbed end. Previous literature shows that loss of expression of EPS8 disrupts the polymerization of F-actin in intestinal microvilli resulting in shortened brush borders. We identified a pediatric IBD patient with a homozygous missense EPS8 mutation(c.2099C>T, I700T) in the actin-binding domain. The patient presented with pancolitis, colonic strictures and other IBD-like symptoms at 6 weeks of age. Currently, the functional role of EPS8 in the pathogenesis of very early-onset IBD remains elusive. Aims 1)To investigate if the patient with EPS8 mutation has microvilli disorganization. 2)To determine EPS8 localization in patient samples and cell models. 3)To clarify the mechanism of how the EPS8 mutation affects F-actin in vitro. Ultimately, we want to clarify how the mutation of EPS8 might contribute to the onset of pediatric IBD. Methods A rare, damaging mutation in EPS8 was identified in a very early-onset IBD patient by Whole Exome Sequencing. From patient-derived colon biopsy samples, the localization of EPS8 and actin was visualized by immunofluorescence (IF) microscopy. The morphology of the patient’s intestinal microvilli was assessed using transmission electron microscopy (TEM). EPS8 expression was measured using western blot. An F-actin polymerization assay was performed comparing purified WT and mutant EPS8 protein to assess the rate of polymerization from monomeric G-actin to F-actin. Results IF microscopy of the colonic sections revealed lower co-localization of EPS8 and actin on the apical surfaces, compared to IBD and normal controls. Closer examination of the cell structure using TEM showed disruption of the microvilli in the EPS8 mutant, but not in IBD or normal controls. Western blots showed no differences in protein expression between wildtype and mutant EPS8 in HEK293T cells. F-actin polymerization assay revealed differences in the rate of G-actin to F-actin polymerization between wildtype and mutant EPS8. Conclusions The patient with EPS8 mutation had microvilli disorganization. EPS8 localized differently in the patient colon tissues compared to normal and IBD control samples. The EPS8 mutation may affect F-actin polymerization, which may lead to disruption of the microvilli. Funding Agencies CIHR
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».