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Enregistrement W3007781433 · doi:10.1371/journal.pone.0229172

Methodology and validation of a new tandem mass spectrometer method for the quantification of inorganic and organic 18O-phosphate species

2020· article· en· W3007781433 sur OpenAlexafffund
Aimée Schryer, Kris Bradshaw, Steven D. Siciliano

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSoil and Water Nutrient Dynamics
Établissements canadiensFederated Co-operatives (Canada)University of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryBicarbonatePhosphateδ18OEnvironmental chemistryFractionationMicrocosmMass spectrometryChromatographyStable isotope ratioBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphorus (P) fertilizers are crucial to achieve peak productivity in agricultural systems. However, the fate of P fertilizers via microorganism incorporation and the exchange processes between soil pools is not well understood. 18Oxygen-labelled phosphate (18O- Pi) can be tracked as it cycles through soil systems. Our study describes biological and geochemical P dynamics using a tandem mass spectrometry (MS/MS) method for the absolute quantification of 18O- Pi. Soil microcosms underwent three treatments: (i) 18O- Pi, (ii) unlabelled phosphate (16O- Pi) or (iii) Milli-Q control, dissolved in a bio-stimulatory solution. During a 6-week series the microcosms were sampled to measure P by Hedley sequential fractionation and DNA extraction samples digested to 3'-deoxynucleoside 5'-monophosphates (dNMP). A MS/MS attached to a HPLC analyzed each P-species through collision-induced dissociation. The resin-extractable and bicarbonate 18O- Pi and 16O- Pi fractions displayed similar precipitation and adsorption-desorption trends. Biotic activity measured in the NaOH and dNMP fractions rapidly delabelled 18O- Pi; however, the MS/MS measured some 18O that remained between the P backbone and deoxyribose sugars. After 6 weeks, the 18O- Pi had not reached the HCl soil pool, highlighting the long-term nature of P movement. Our methodology improves on previous isotopic tracking methods as endogenous P does not dilute the system, unlike 32P techniques, and measured total P is not a ratio, dissimilar from natural abundance techniques. Measuring 18O- Pi using MS/MS provides information to enhance land sustainability and stewardship practices regardless of soil type by understanding both the inorganic movement of P fertilizers and the dynamic P pool in microbial DNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,149 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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