Fecal bacterial community of finishing beef steers fed ruminally protected and non-protected active dried yeast
Notice bibliographique
Résumé
Our previous study suggested that supplementation of high-grain diets with ruminally protected and non-protected active dried yeast (ADY) may potentially reduce manure pathogen excretion by feedlot cattle. We hypothesized that feeding ruminally protected ADY might change the fecal bacterial community of finishing cattle. The objective of this study was to investigate the effects of feeding ruminally protected and non-protected ADY to finishing beef steers on their fecal bacterial community. Fresh fecal samples were collected on day 56 from 50 steers fed one of five treatments: 1) control (no monensin, tylosin, or ADY), 2) antibiotics (ANT, 330 mg monensin + 110 mg tylosin·steer-1d-1), 3) ADY (1.5 g·steer-1d-1), 4) encapsulated ADY (EDY; 3 g·steer-1d-1), and 5) a mixture of ADY and EDY (MDY; 1.5 g ADY + 3 g EDY·steer-1d-1). Bacterial DNA was extracted from fecal samples and sequenced using a MiSeq high-throughput sequencing platform. A total number of 2,128,772 high-quality V4 16S rRNA sequences from 50 fecal samples were analyzed, and 1,424 operational taxonomic units (OTU) were detected based on 97% nucleotide sequence identity among reads, with 769 OTU shared across the five treatments. Alpha diversity indices, including species observed, Chao estimate, abundance-based coverage estimator, Shannon, Simpson, and coverage, did not differ among treatments, and principal coordinate analysis revealed a high similarity among treatments without independent distribution. Bacteroidetes and Firmicutes were dominant phyla in the fecal bacterial community for all treatments, with a tendency (P < 0.10) for greater relative abundance of Bacteroidetes but lesser Firmicutes with ANT, EDY, and MDY compared with control steers. Prevotella was the dominant genus in all treatments and steers supplemented with ANT, EDY, and MDY had greater (P < 0.05) relative abundance of Prevotella than control steers, but lesser (P < 0.03) relative abundance of Oscillospira. No differences between ADY and control were observed for the aforementioned variables. Fecal starch contents were not different among treatments, but the relative abundance of Bacteroidetes, as well as Prevotella at genera level, tended (P < 0.06) to be positively correlated to fecal starch content. We conclude that supplementing ruminally protected or non-protected ADY or ANT had no effect on diversity and richness of fecal bacteria of finishing beef cattle, whereas feeding protected ADY or ANT to finishing beef steers altered the dominant fecal bacteria at phylum and genus levels. Therefore, supplementation of ruminally protected ADY may potentially improve intestinal health by stimulating the relative abundance of Prevotella.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».