Quantitative expansion microscopy for the characterization of the spectrin periodic skeleton of axons using fluorescence microscopy
Notice bibliographique
Résumé
Fluorescent nanoscopy approaches have been used to characterize the periodic organization of actin, spectrin and associated proteins in neuronal axons and dendrites. This membrane-associated periodic skeleton (MPS) is conserved across animals, suggesting it is a fundamental component of neuronal extensions. The nanoscale architecture of the arrangement (190 nm) is below the resolution limit of conventional fluorescent microscopy. Fluorescent nanoscopy, on the other hand, requires costly equipment and special analysis routines, which remain inaccessible to most research groups. This report aims to resolve this issue by using protein-retention expansion microscopy (pro-ExM) to reveal the MPS of axons. ExM uses reagents and equipment that are readily accessible in most neurobiology laboratories. We first explore means to accurately estimate the expansion factors of protein structures within cells. We then describe the protocol that produces an expanded specimen that can be examined with any fluorescent microscopy allowing quantitative nanoscale characterization of the MPS. We validate ExM results by direct comparison to stimulated emission depletion (STED) nanoscopy. We conclude that ExM facilitates three-dimensional, multicolor and quantitative characterization of the MPS using accessible reagents and conventional fluorescent microscopes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».