MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3008129165 · doi:10.1093/jcag/gwz047.259

A260 THE LACK OF CHROMOGRANIN-A MODIFIES THE GUT MICROBIOTA COMPOSITION AND REGULATES EXPERIMENTAL COLONIC INFLAMMATION

2020· article· en· W3008129165 sur OpenAlexaff
Nour Eissa, A. Diarra, Hayam Hussein, Çharles N. Bernstein, Jean‐Eric Ghia

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiomeChromogranin ABiologyGut floraDysbiosisFecesMicrobiologyImmunologyBioinformaticsImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Ulcerative colitis (UC)is characterized by distinct changes in the gut microbiome and elevated chromogranin-A (CHGA) level, which seem to be a relevant pathogenetic mechanism.CHGA, a prohormone produced by enterochromaffin (EC) cells and cleaved into several bioactive peptides, regulates experimental colonic inflammation. In the rodent, intra-rectal infusion of catestatin, a Chga-derived peptide, alters the distal colonic microbial composition. However, the interplay between CHGA, as a pro-hormone, and the gut microbiome remains elusive. Aims in homoeostatic and pathophysiologic conditions, we investigated the functional consequences of the lack of Chgaon the distal colonic microbiota. Methods Acute colitis (5 % dextran sulfate sodium [DSS], 5 days) was induced in Chga-C57BL/6-deficient (Chga-/-) and wild-type (Chga+/+)mice. Feces and mucosa-associated microbiota (MAM) samples were collected and the V4 region of 16s rRNA was subjected to Miseq Illumina sequencing. Alpha diversity was calculated using Shannon’s diversity index. OTU abundances were summarized using the Bray-Curtis index and non-metric multidimensional scaling (NMDS) analysis to visualize microbiome similarities and a permutational analysis of variance (PERMANOVA) to test the significance of groups were performed respectively. Results In non-colitic homoeostatic condition, the absence of Chga (Chga-/) significantly increased the bacterial richness and modified the bacterial community composition at the genera level between the groups, represented by increased abundance of Lactobacillus species and reduced abundance of Helicobacter& Oscillospira species compared to Chga+/+mice in fecal and colonic MAM. Moreover, the absence of Chga (Chga-/-) resulted in a significant change in the alpha-diversity of fecal and colonic MAM compared to Chga+/+mice. DSS induced-colitis resulted in a significant microbial dysbiosis in Chga+/+mice, however, deletion of Chgaprotected against DSS-induced colitis and reduced the microbial dysbiosis, reduced the family of Rikenellaceaeand maintained the abundance of Bacteroides species, compared to wild-type (Chga+/+). Conclusions The lack of CHGA regulates the biodiversity and the composition of the colonic gut microbiota suggesting a cross-talk between the EC cell and the microbiome. Therefore, targeting CHGA could provide a novel therapeutic strategy by regulating the gut microbiome in physiological and pathophysiological conditions. Funding Agencies CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology→Même sujetProbiotics and Fermented Foods→Travaux en français237 207→