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Enregistrement W3008229845 · doi:10.1002/pros.23966

A synopsis of prostate organoid methodologies, applications, and limitations

2020· review· en· W3008229845 sur OpenAlexafffund
Anna Gleave, Xinpei Ci, Dong Lin, Yuzhuo Wang

Notice bibliographique

RevueThe Prostate · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUrology FoundationNational Cancer InstituteProstate Cancer FoundationInstitut National Du CancerCanadian Institutes of Health ResearchMitacsTerry Fox Research InstituteProstate Cancer Canada
Mots-clésOrganoidProstateMedicineProstate diseaseComputer sciencePathologyComputational biologyBiologyInternal medicineNeuroscienceCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Current in vitro modeling systems do not fully reflect the biologic and clinical diversity of prostate cancer (PCa). Organoids are 3D in vitro cell cultures that recapitulate disease heterogeneity, retain prostate gland architecture, and mirror parental tumor characteristics. METHODS: To make better use of organoid models in the PCa research field, we provide a review of cutting-edge prostate organoid methodologies, applications, and limitations. RESULTS: We summarize methodologies for the establishment of benign prostate and PCa organoids and describe some of the model's practical applications and challenges. We highlight the patient-derived xenograft (PDX)-organoid interface model, which may allow for the generation of organoids from primary and rare PCa subtypes. Finally, we discuss potential future utilizations of PCa organoids in the realms of drug development and precision oncology. CONCLUSIONS AND FUTURE DIRECTIONS: Organoids represent a quasi in vivo modeling system that can be easily amenable to genetic modification and functional studies. As such, organoids may serve as an intermediate preclinical model for studying PCa. Future directions may include the refinement of culturing conditions to increase drug response fidelity in PCa organoids. The PDX-organoid interface model may enable the future establishment of primary and rare subtype PCa organoid lines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,181
Tête enseignante GPT0,392
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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