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Enregistrement W3008351852 · doi:10.1152/physiolgenomics.00104.2019

Circulating and tissue matricellular RNA and protein expression in calcific aortic valve disease

2020· article· en· W3008351852 sur OpenAlex
Alexander P. Kossar, Wanda Anselmo, Juan B. Grau, Yichuan Liu, Aeron Small, Lisa Salvador, Lei Zhao, Mary Ellen Cvijic, Zhuyin Li, Melissa Yarde, Nancy Rioux, Daniel J. Rader, Robert J. Levy, Giovanni Ferrari

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePhysiological Genomics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Valve Diseases and Treatments
Établissements canadiensOttawa Heart Institute
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteChildren's Hospital of Philadelphia
Mots-clésAortic valveAsymptomaticAortic valve stenosisCardiologyStenosisMedicineInternal medicinevalvular heart diseaseAortic valve replacementBicuspid aortic valve

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aortic valve sclerosis is a highly prevalent, poorly characterized asymptomatic manifestation of calcific aortic valve disease and may represent a therapeutic target for disease mitigation. Human aortic valve cusps and blood were obtained from 333 patients undergoing cardiac surgery ( n = 236 for severe aortic stenosis, n = 35 for asymptomatic aortic valve sclerosis, n = 62 for no valvular disease), and a multiplex assay was used to evaluate protein expression across the spectrum of calcific aortic valve disease. A subset of six valvular tissue samples ( n = 3 for asymptomatic aortic valve sclerosis, n = 3 for severe aortic stenosis) was used to create RNA sequencing profiles, which were subsequently organized into clinically relevant gene modules. RNA sequencing identified 182 protein-encoding, differentially expressed genes in aortic valve sclerosis vs. aortic stenosis; 85% and 89% of expressed genes overlapped in aortic stenosis and aortic valve sclerosis, respectively, which decreased to 55% and 84% when we targeted highly expressed genes. Bioinformatic analyses identified six differentially expressed genes encoding key extracellular matrix regulators: TBHS2, SPARC, COL1A2, COL1A1, SPP1, and CTGF. Differential expression of key circulating biomarkers of extracellular matrix reorganization was observed in control vs. aortic valve sclerosis (osteopontin), control vs. aortic stenosis (osteoprotegerin), and aortic valve sclerosis vs. aortic stenosis groups (MMP-2), which corresponded to valvular mRNA expression. We demonstrate distinct mRNA and protein expression underlying aortic valve sclerosis and aortic stenosis. We anticipate that extracellular matrix regulators can serve as circulating biomarkers of early calcific aortic valve disease and as novel targets for early disease mitigation, pending prospective clinical investigations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,913
Score d'incertitude au seuil0,396

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle