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Enregistrement W3008422356 · doi:10.3389/fendo.2020.00065

Reporting Guidelines, Review of Methodological Standards, and Challenges Toward Harmonization in Bone Marrow Adiposity Research. Report of the Methodologies Working Group of the International Bone Marrow Adiposity Society

2020· review· en· W3008422356 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Endocrinology · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHematological disorders and diagnostics
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesKennedy Trust for Rheumatology ResearchMedical Research CouncilSapienza Università di RomaSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungUniversity of OxfordUniversité de NantesÉcole Polytechnique Fédérale de LausanneLeukaemia UKAgence Nationale de la RechercheMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaNational Science Foundation
Mots-clésBone marrowMedicineOncologyIn vivoInternal medicinePathologyBioinformaticsBiologyBiotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The interest in bone marrow adiposity (BMA) has increased over the last decade due to its association with, and potential role, in a range of diseases (osteoporosis, diabetes, anorexia, cancer) as well as treatments (corticosteroid, radiation, chemotherapy, thiazolidinediones). However, to advance the field of BMA research, standardization of methods is desirable to increase comparability of study outcomes and foster collaboration. Therefore, at the 2017 annual BMA meeting, the International Bone Marrow Adiposity Society (BMAS) founded a working group to evaluate methodologies in BMA research. All BMAS members could volunteer to participate. The working group members, who are all active preclinical or clinical BMA researchers, searched the literature for articles investigating BMA and discussed the results during personal and telephone conferences. According to the consensus opinion, both based on the review of the literature and on expert opinion, we describe existing methodologies and discuss the challenges and future directions for 1) histomorphometry of bone marrow adipocytes, 2) ex vivo BMA imaging, 3) in vivo BMA imaging, 4) cell isolation, culture, differentiation and in vitro modulation of primary bone marrow adipocytes and bone marrow stromal cell precursors, 5) lineage tracing and in vivo BMA modulation, and 6) BMA biobanking. We identify as accepted standards in BMA research: manual histomorphometry and osmium tetroxide 3D contrast-enhanced μCT for ex vivo quantification, specific MRI sequences (WFI and H-MRS) for in vivo studies, and RT-qPCR with a minimal four gene panel or lipid-based assays for in vitro quantification of bone marrow adipogenesis. Emerging techniques are described which may soon come to complement or substitute these gold standards. Known confounding factors and minimal reporting standards are presented, and their use is encouraged to facilitate comparison across studies. In conclusion, specific BMA methodologies have been developed. However, important challenges remain. In particular, we advocate for the harmonization of methodologies, the precise reporting of known confounding factors, and the identification of methods to modulate BMA independently from other tissues. Wider use of existing animal models with impaired BMA production (e.g. Pfrt-/-, KitW/W−v) and development of specific BMA deletion models would be highly desirable for this purpose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,120
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,857
Score d'incertitude au seuil0,888

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,120
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,480
Tête enseignante GPT0,478
Écart entre enseignants0,001 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle