A210 ADLERCREUTZIA IS DEPLETED IN UC PATIENTS, EVEN BEFORE CLINICAL DIAGNOSIS, AND INVERSELY CORRELATES WITH FECAL ELASTOLYTIC ACTIVITY
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background A combination of genetics, environmental, and immune factors contribute to the development of ulcerative colitis (UC). Host proteolytic imbalance has been reported in active UC. Preliminary results from our lab suggest microbial proteolytic activity is increased before as well as after onset of UC, and transfer of this activity to mice contributes to inflammation. Aims Our aim was to correlate the elastolytic activity of fecal samples from individuals at risk for IBD, before and after onset of ulcerative colitis, with their fecal microbiota profiles Methods We first investigated proteolytic activity in fecal samples from individuals at risk to develop UC (pre-UC, n=12) prior to disease onset and after UC diagnosis (post-UC, n=7) and matched healthy controls (n=66). Microbial community analysis was performed by sequencing the V4 region of the 16S rRNA gene region using Illumina MiSeq platform. Sequences were analyzed with QIIMEv1.9.0. We measured bacterial proteolytic activity, using a FITC-elastin assay. Results Microbial community analysis revealed that the overall diversity (both richness and evenness) in UC patients was decreased compared to healthy controls as well as pre-UC patients. The relative abundance of the genus Adlercreutzia was decreased by 3.1 fold in pre-UC patients compared to healthy controls and was further decreased in post-UC (3.8 fold). The presence of Adlercreutzia was also found to be negatively correlated (r=-0.47, p<0.0001) with elastolytic activity in stool supernatant, suggesting a possible protective role in the disease. Conclusions We found novel potentially protective bacteria, Adlercreutzia, which was depleted in UC patients, even before clinical diagnosis and correlated negatively with proinflammatory elastolytic activity described previously in IBD. The protective mechanisms are under investigation. On behalf of the CCC-GEM Project consortiumand Supported by a CCC GIA to EFV Funding Agencies CCC
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».