Relapse-Fated Latent Diagnosis Subclones in Acute B Lineage Leukemia Are Drug Tolerant and Possess Distinct Metabolic Programs
Notice bibliographique
Résumé
Disease recurrence causes significant mortality in B-progenitor acute lymphoblastic leukemia (B-ALL). Genomic analysis of matched diagnosis and relapse samples shows relapse often arising from minor diagnosis subclones. However, why therapy eradicates some subclones while others survive and progress to relapse remains obscure. Elucidation of mechanisms underlying these differing fates requires functional analysis of isolated subclones. Here, large-scale limiting dilution xenografting of diagnosis and relapse samples, combined with targeted sequencing, identified and isolated minor diagnosis subclones that initiate an evolutionary trajectory toward relapse [termed diagnosis Relapse Initiating clones (dRI)]. Compared with other diagnosis subclones, dRIs were drug-tolerant with distinct engraftment and metabolic properties. Transcriptionally, dRIs displayed enrichment for chromatin remodeling, mitochondrial metabolism, proteostasis programs, and an increase in stemness pathways. The isolation and characterization of dRI subclones reveals new avenues for eradicating dRI cells by targeting their distinct metabolic and transcriptional pathways before further evolution renders them fully therapy-resistant. SIGNIFICANCE: Isolation and characterization of subclones from diagnosis samples of patients with B-ALL who relapsed showed that relapse-fated subclones had increased drug tolerance and distinct metabolic and survival transcriptional programs compared with other diagnosis subclones. This study provides strategies to identify and target clinically relevant subclones before further evolution toward relapse.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».