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Enregistrement W3008774286 · doi:10.1093/jcag/gwz047.246

A247 VIRAL LOAD OF EPSTEIN-BARR VIRUS IN PEDIATRIC PATIENTS WITH NEW ONSET IBD AT DIAGNOSIS AND ON FOLLOW UP: AN OBSERVATIONAL STUDY

2020· article· en· W3008774286 sur OpenAlexaff
G A Kornitzer, M Rosenstein, Véronique Groleau, Prévost Jantchou, Fabien Touzot, D. V. Godin, Christian Renaud, Philippe Ovetchkine, Colette Deslandres

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineViral loadSerologyInternal medicineInflammatory bowel diseaseImmunologyPopulationRetrospective cohort studyDiseaseVirusCohortEpstein–Barr virusGastroenterologyAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Patients with Inflammatory Bowel Disease are at increased risk for complications associated with Epstein-Barr Virus, such as uncontrolled infection, colitis mimicking IBD, and lymphoproliferative disease. These complications may be due to inherent immune dysfunction or effects of immunomodulating therapies used. We have previously identified that the seroprevalence of EBV in our cohort of IBD patients at time of diagnosis was 44.2%, with prevalence stratified by age as follows: 0 to <10 years 36%, 10 to <17 years 46%, and 17 + years 50%. Aims Our objective is to assess the risk of EBV reactivation in this population, to determine whether patients treated with immunomodulators should be more closely monitored for EBV viral load. Methods Retrospective chart review was done for all patients with new-onset IBD diagnosed at CHU Sainte-Justine over a two-year period, from Jan. 2016 to Dec. 2017. Serum from time of diagnosis was retrieved from the microbiology laboratory for patients with positive EBV serology, and quantitative PCR was performed to assess viral load at diagnosis. 47 of 53 seropositive patients had available serum at time of retrieval. EBV PCR was subsequently performed on serum drawn one to two years after start of immunosuppressants. Results 53 patients were EBV positive at time of diagnosis (EBNA/VCA IgG). Two patients were IgM positive, suggesting recent or active infection. The viral load as measured by quantitative PCR on serum drawn at diagnosis was negative in all retroactively tested patients. Of the two IgM-positive patients, one had known positive quantitative PCR at time of diagnosis. PCR previously tested in clinical follow-up of two seropositive, PCR-negative patients became positive at 7 and 17 months from diagnosis, suggesting viral reactivation. Both patients had received anti-TNF’s and systemic corticosteroids. Viral loads on follow-up are to be assessed for the rest of the cohort. Overall, therapies started within 6 months of diagnosis were similar in the seropositive and seronegative groups, the majority receiving some form of immunosuppression. Within the seropositive group: 66% received corticosteroids, 32.1% Infliximab, 5.7% Adalimumab, and 5.7% Azathioprine. Conclusions Only one patient had active EBV infection with positive PCR at time of diagnosis. All other patients had no sign of active infection based on retroactive PCR’s. While a majority of patients, regardless of EBV serology, receive immunomodulating agents, we currently do not routinely screen for seroconversion in seronegative patients, or for viral load in seropositive patients. We will be assessing viral loads after start of immunomodulation to better understand the potential impact of these agents on disease progression. Funding Agencies None

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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