Size matters: the effects of ontogenetic disparity on the phylogeny of Trematopidae (Amphibia: Temnospondyli)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Trematopids are a clade of terrestrial Permo-Carboniferous temnospondyl amphibians. The intrarelationships of this clade are poorly known. This is largely attributable to a substantial disparity in size between type specimens, which range from the small-bodied lectotype of Mattauschia laticeps (< 4 cm skull length) to the large-bodied holotype of Acheloma cumminsi (> 15 cm skull length). Inferred correlation of size disparity with ontogenetic disparity has led previous workers either to omit taxa in phylogenetic analyses or to forgo an analysis altogether. Here, I take a specimen-level approach and multiple subsampling permutations to explore the phylogeny of the Trematopidae as a case study for assessing the effects of ontogenetic disparity on phylogenetic reconstruction in temnospondyls. The various analyses provide evidence that ontogenetic disparity confounds the phylogenetic inference of trematopids but without a directional bias. Tree topologies of most permutations are poorly resolved and weakly supported, reflecting character conflict that results from the inability of the analyses to differentiate retained plesiomorphies from juvenile features. These findings urge caution in the interpretation of phylogenetic analyses for which ontogenetic disparity exists, but is unaccounted for, and provide a strong impetus for more directed exploration of the interplay of ontogeny and phylogeny across Temnospondyli.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».