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Enregistrement W3009159270 · doi:10.5539/jas.v12n4p64

Genome Introgression of Híbrido de Timor and Its Potential to Develop High Cup Quality C. arabica Cultivars

2020· article· en· W3009159270 sur OpenAlexvenueno aff
Tesfahun Alemu Setotaw, Eveline Teixeira Caixeta, Eunize Maciel Zambolim, Tiago Vieira Sousa, Antônio Alves Pereira, Antonio Carlos Baião, Cosme Damião Cruz, Laércio Zambolim, Ney Sussumu Sakiyama

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoffee research and impacts
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIntrogressionBiologyCultivarGenomeBotanyHorticultureGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Híbrido de Timor is the principal source for disease and pest resistance genes in C. arabica breeding program worldwide. The part of the chromosome responsible for resistance introgressed from C. canephora to Híbrido de Timor are claimed to affect the cup quality of the C. arabica cultivars derived from the crossing program of Híbrido de Timor. Therefore, this work was done to study the genome introgression of Híbrido de Timor and its impact on the cup quality on the C. arabica cultivars. For genome introgression and genetic relationship analysis, seventy-six accessions from C. arabica, C. canephora and Híbrido de Timor were analyzed using AFLP and SSR molecular markers. To understand the effect of genome introgressed from Híbrido de Timor on cup quality, three C. arabica, seven Híbrido de Timor and six cultivars derived from Híbrido de Timor × C. arabica were genotyped using SSR molecular markers and sensorial analysis was performed. The genetic diversity analysis among the tested genotypes showed high genetic similarity between Híbrido de Timor with C. arabica and clear differentiation among coffee species. The analysis of genome introgression of C. arabica and C. canephora var Robusta into Híbrido de Timor not reach 30% of C. canephora genome. The sensorial analysis of coffee genotypes demonstrated non-significant difference on cup quality parameters among C. arabica cv Bourbon and cultivars derived from Híbrido de Timor that showed the possibility of developing C. arabica cultivars without affecting the cup quality. Similarly, the SSR marker diversity showed high genetic similarity between the Bourbon and the C. arabica cultivars derived from Híbrido de Timor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,920
Score d'incertitude au seuil0,314

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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