Association Between the Functional <i>miR-146a</i> SNP <i>rs2910164</i> and Risk of Digestive System Cancer: Updated Meta-analysis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND/AIM: Previous association studies have linked the functional miR-146a SNP rs2910164 with risk of digestive system cancer; however, the results of these studies are inconclusive and inconsistent. The objective of the following study is to provide an up-to-date and comprehensive meta-analysis of the association of miR-146a rs2910164 and digestive system cancer risk. PATIENTS AND METHODS: We searched the PUBMED/MEDLINE and Cochrane/EBM databases. The following inclusion criteria were used for the study selection: i) Case-control studies; ii) studies with reported allelic frequency/genotype data; and iii) studies with reported association with risk of a digestive system cancer. The following exclusion criteria were used: Review article, meta-analysis, case report and case series; studies evaluating relationships of miR-146a rs2910164 with outcomes other than cancer incidence, such as cancer morbidity or mortality. Study quality was assessed using the Newcastle-Ottawa Scale and publication bias assessed graphically and numerically using Begg's funnel plot and Egger's regression test and rank test. Outcome measure was the pooled odds ratios under the allelic frequency, dominant, recessive, and over-dominant models. Subgroup analysis was conducted for country of study origin. RESULTS: No association of miR-146a rs2910164 with overall risk of digestive system cancer was identified. However, subgroup analysis showed an association with overall risk in the European population in the over-dominant model. Furthermore, miR-146a rs2910164 was associated with reduced risk of gastric cancer in the dominant model (pooled odds ratio=0.91, 95% confidence intervaI=0.83-0.99), increased risk of colorectal cancer under the recessive model and reduced risk of colorectal cancer under the over-dominant model in the European population. No significant within-study or publication biases were detected. CONCLUSION: miR-146a rs2910164 was not associated with overall risk of digestive system neoplasms. However, the GG genotype and the CC genotype may be linked to higher risk of gastric cancer and colorectal cancer, respectively; and the CG genotype may be protective against digestive system neoplasms overall in the European population, especially for colorectal cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,010 | 0,018 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,012 | 0,041 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».