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Enregistrement W3009187007 · doi:10.21873/anticanres.14094

Association Between the Functional <i>miR-146a</i> SNP <i>rs2910164</i> and Risk of Digestive System Cancer: Updated Meta-analysis

2020· review· en· W3009187007 sur OpenAlexaboutno aff
Robin Park, Laércio Lopes da Silva, Anwaar Saeed

Notice bibliographique

RevueAnticancer Research · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeta-analysisOdds ratioFunnel plotSubgroup analysisPublication biasMedicineInternal medicineCancerOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND/AIM: Previous association studies have linked the functional miR-146a SNP rs2910164 with risk of digestive system cancer; however, the results of these studies are inconclusive and inconsistent. The objective of the following study is to provide an up-to-date and comprehensive meta-analysis of the association of miR-146a rs2910164 and digestive system cancer risk. PATIENTS AND METHODS: We searched the PUBMED/MEDLINE and Cochrane/EBM databases. The following inclusion criteria were used for the study selection: i) Case-control studies; ii) studies with reported allelic frequency/genotype data; and iii) studies with reported association with risk of a digestive system cancer. The following exclusion criteria were used: Review article, meta-analysis, case report and case series; studies evaluating relationships of miR-146a rs2910164 with outcomes other than cancer incidence, such as cancer morbidity or mortality. Study quality was assessed using the Newcastle-Ottawa Scale and publication bias assessed graphically and numerically using Begg's funnel plot and Egger's regression test and rank test. Outcome measure was the pooled odds ratios under the allelic frequency, dominant, recessive, and over-dominant models. Subgroup analysis was conducted for country of study origin. RESULTS: No association of miR-146a rs2910164 with overall risk of digestive system cancer was identified. However, subgroup analysis showed an association with overall risk in the European population in the over-dominant model. Furthermore, miR-146a rs2910164 was associated with reduced risk of gastric cancer in the dominant model (pooled odds ratio=0.91, 95% confidence intervaI=0.83-0.99), increased risk of colorectal cancer under the recessive model and reduced risk of colorectal cancer under the over-dominant model in the European population. No significant within-study or publication biases were detected. CONCLUSION: miR-146a rs2910164 was not associated with overall risk of digestive system neoplasms. However, the GG genotype and the CC genotype may be linked to higher risk of gastric cancer and colorectal cancer, respectively; and the CG genotype may be protective against digestive system neoplasms overall in the European population, especially for colorectal cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,018
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,055

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,018
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0120,041
Bibliométrie0,0050,006
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,134
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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