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Enregistrement W3009500215 · doi:10.3390/ijms21051737

Amino Acids 563–566 of the Na+/H+ Exchanger Isoform 1 C-Terminal Cytosolic Tail Prevent Protein Degradation and Stabilize Protein Expression and Activity

2020· article· en· W3009500215 sur OpenAlexaff
Xiuju Li, Debajyoti Dutta, Martin Jung, Richard Zimmermann, Larry Fliegel

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCytosolAmino acidExtracellularSodium–hydrogen antiporterGene isoformBiochemistryPeptide sequenceIntracellularProtein degradationN-terminusIntracellular pHBiologyChemistryMolecular biologyEnzymeSodiumGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Isoform one of the mammalian Na+/H+ exchanger is a plasma membrane protein that is ubiquitously present in humans. It regulates intracellular pH through the removal of one intracellular proton in exchange for a single extracellular sodium. It consists of a 500 amino acid membrane domain plus a 315 amino acid, C-terminal tail. We examined amino acids of the C-terminal tail that are important in the targeting and activity of the protein. A previous study demonstrated that stop codon polymorphisms can result in decreased activity, expression, targeting and enhanced protein degradation. Here, we determine elements that are critical in these anomalies. A series of progressive deletions of the C-terminal tail demonstrated a progressive decrease in activity and targeting, though these remained until a final drop off with the deletion of amino acids 563–566. The deletion of the 562LIAGERS568 sequence or the alteration to the 562LAAAARS568 sequence caused the decreased protein expression, aberrant targeting, reduced activity and enhanced degradation of the Na+/H+ exchanger (NHE1) protein. The 562LIAGERS568 sequence bound to other regions of the C-terminal cytosolic domain. We suggest this region is necessary for the activity, targeting, stability, and expression of the NHE1 protein. The results define a new sequence that is important in maintenance of NHE1 protein levels and activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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