Identification of HO-1 as a novel biomarker for graft acute cellular rejection and prognosis prediction after liver transplantation
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Liver transplantation (LT) is the most effective treatment for patients with end-stage liver diseases, but acute rejection is still a major concern. However, the mechanisms underlying rejection remain unclear. Biomarkers are lacking for predicting rejection and long-term survival after LT. METHODS: Isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ)-based proteomics was performed between acute cellular rejection (ACR) and non-rejection recipients. The molecular signature differences and potential biomarkers were identified by comprehensive bioinformatics. Heme oxygenase-1 (HO-1) expression and its association with clinical outcomes were investigated by tissue microarrays consisted of liver specimens from recipients with (n=80) and without ACR (n=57). RESULTS: A total of 287 differentially expressed proteins (DEPs) were identified. Pathway analysis revealed that T/B cell activation, integrin/inflammation signaling pathway, etc. were significantly correlated with ACR. Through comprehensive bioinformatics, HO-1 was identified as a candidate potential biomarker for ACR. In tissue microarray (TMA) analysis, HO-1 expression was significantly higher in ACR group than in non-rejection group (P<0.01). Preoperative Child-Pugh and Meld scores were significantly higher in recipients with high HO-1 expression (P<0.01). In a mean 5-year follow-up, recipients with high HO-1 expression were associated with a shorter overall survival (P<0.05). Further multivariate analyses indicated that HO-1 could be an independent adverse prognostic factor for post-transplant survival (P=0.005). CONCLUSIONS: A total of 287 DEPs were identified, providing a set of targets for further research. Recipients with high preoperative HO-1 expression were associated with ACR. HO-1 may be used as a potential biomarker for predicting the development of post-transplant allograft ACR and recipient's survival.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».