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Enregistrement W3010049557

Infection as a potential cofactor in the genetic-epigenetic pathophysiology of endometriosis: a systematic review.

2019· article· en· W3010049557 sur OpenAlexaff
PR Koninckx, Anastasia Ussia, Muna Tahlak, L.V. Adamyan, Arnaud Wattiez, Dan C. Martin, Gomel

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEndometriosis Research and Treatment
Établissements canadiensB.C. Women's Hospital & Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiomeEndometriosisEndometritisDysbiosisBiologyBacterial vaginosisUreaplasmaShigella flexneriPelvic inflammatory diseaseImmunologyMedicineMicrobiologyEscherichia coliMycoplasmaBioinformaticsGynecologyGeneticsPregnancy
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The genetic-epigenetic theory postulates that endometriosis is triggered by a cumulative set of genetic-epigenetic (GE) incidents. Pelvic and upper genital tract infection might induce GE incidents and thus play a role in the pathogenesis of endometriosis. Thus, this article aims to review the association of endometriosis with upper genital tract and pelvic infections. METHODS: Pubmed, Scopus and Google Scholar were searched for 'endometriosis AND (infection OR PID OR bacteria OR viruses OR microbiome OR microbiota)', for 'reproductive microbiome' and for 'reproductive microbiome AND endometriosis', respectively. All 384 articles, the first 120 'best match' articles in PubMed for 'reproductive microbiome' and the first 160 hits in Google Scholar for 'reproductive microbiome AND endomytriosis' were hand searched for data describing an association between endometriosis and bacterial, viral or other infections. All 31 articles found were included in this manuscript. RESULTS: Women with endometriosis have a significantly increased risk of lower genital tract infection, chronic endometritis, severe PID and surgical site infections after hysterectomy. They have more colony forming units of Gardnerella, Streptococcus, Enterococci and Escherichia coli in the endometrium. In the cervix Atopobium is absent, but Gardnerella, Streptococcus, Escherichia, Shigella, and Ureoplasma are increased. They have higher concentrations of Escherichia Coli and higher concentrations of bacterial endotoxins in menstrual blood. A Shigella/Escherichia dominant stool microbiome is more frequent. The peritoneal fluid of women with endometriosis contains higher concentrations of bacterial endotoxins and an increased incidence of mollicutes and of HPV viruses. Endometriosis lesions have a specific bacterial colonisation with more frequently mollicutes (54%) and both high and medium-risk HPV infections (11%). They contain DNA with 96% homology with Shigella. In mice transplanted endometrium changes the gut microbiome while the gut microbiome influences the growth of these endometriosis lesions. CONCLUSIONS: Endometriosis is associated with more upper genital tract and peritoneal infections. These infections might be co-factors causing GE incidents and influencing endometriosis growth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,789
Score d'incertitude au seuil0,865

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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