Quantitative immunohistochemical (IHC) assessment of ataxia-telangiectasia mutated (ATM) in estrogen receptor (ER) negative early breast cancer (BC).
Notice bibliographique
Résumé
e21083 Background: ATM plays a key role in the cellular response to DNA damage and germline mutations are associated with a predisposition to BC. We evaluated the impact of ATM expression on outcomes in Stage I-III ER negative BC patients (pts). Methods: A tissue microarray was constructed from formalin-fixed paraffin-embedded specimens of ER negative Stage I-III BC pts from the Tom Baker Cancer Centre. ATM expression was assessed by quantitative fluorescence IHC using a rabbit anti-ATM monoclonal antibody (Epitomics) and the HistoRx AQUA platform. ATM expression index (EI) was calculated by the tumor cell to stroma expression ratio. Prognostic ability of ATM EI was explored univariately, and multivariately after adjusting for clinicopathological factors selected using algorithmic methods, with Cox regression methods. Results: Of 126 eligible pts treated from 1999-2004, 44.4% were HER2-neu + and 52.4% were triple negative. ATM EI was normalized using a logarithmic transformation. Univariately, higher ATM EI was associated with worse outcomes (Table). Multivariately, higher ATM EI remained significantly prognostic for recurrence-free survival (RFS) (HR=5.46, p=0.046), local RFS (HR=5.56, p=0.052), distant RFS (HR=4.38, p=0.080), but not overall survival (p=0.48). Conclusions: High ATM EI is associated with worse RFS in ER negative BC in this hypothesis-generating study. Validation of this finding is currently ongoing. [Table: see text]
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».