Phylogenetic evidence for an expanded circumscription of <i>Gabura</i> (<i>Arctomiaceae</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Since the advent of molecular taxonomy, numerous lichen-forming fungi with homoiomerous thalli initially classified in the family Collemataceae Zenker have been transferred to other families, highlighting the extent of morphological convergence within Lecanoromycetes O. E. Erikss. & Winka. While the higher level classification of these fungi might be clarified by such transfers, numerous specific and generic classifications remain to be addressed. We examined the relationships within the broadly circumscribed genus Arctomia Th. Fr., which has been the recipient of several transfers from Collemataceae. We demonstrated that Arctomia insignis (P. M. Jørg. & Tønsberg) Ertz does not belong to Arctomia s. str. but forms a strong monophyletic group with Gabura fascicularis (L.) P. M. Jørg. We also confirmed that Arctomia borbonica Magain & Sérus. and the closely related Arctomia insignis represent two species. We formally transferred A. insignis and A. borbonica to the genus Gabura Adans. and introduced two new combinations: Gabura insignis and Gabura borbonica. We reported Gabura insignis from Europe (Scotland and Ireland) for the first time. While material from Europe and North America is genetically almost identical, specimens from Madagascar, South Africa and Reunion Island belong to three distinct phylogenetic lineages, all of which are present in the latter area and may represent distinct species. In its current circumscription, the genus Gabura may contain up to six species, whereas Arctomia s. str. includes only two species (A. delicatula Th. Fr. and A. teretiuscula P. M. Jørg.). The Gabura insignis group is shown to have an unexpectedly large, subcosmopolitan distribution. With the extended sampling from Arctomiaceae Th. Fr., the placement of Steinera sorediata P. James & Henssen in the genus Steinera Zahlbr. is confirmed and the presence of a new Steinera species from Chile is highlighted.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».