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Enregistrement W3010660902 · doi:10.3390/app10061903

Multimodal Ensemble-Based Segmentation of White Matter Lesions and Analysis of Their Differential Characteristics across Major Brain Regions

2020· article· en· W3010660902 sur OpenAlexaff
Saima Rathore, Tamim Niazi, Muhammad Aksam Iftikhar, Ashish Singh, Batool Rathore, Michel Bilello, Ahmad Chaddad

Notice bibliographique

RevueApplied Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArtificial intelligencePattern recognition (psychology)SegmentationComputer scienceHyperintensityFluid-attenuated inversion recoveryVoxelWhite matterFalse positive paradoxMagnetic resonance imagingMedicineRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

White matter lesions (WML) are common in a variety of brain pathologies, including ischemia affecting blood vessels deeper inside the brain’s white matter, and show an abnormal signal in T1-weighted and FLAIR images. The emergence of personalized medicine requires quantification and analysis of differential characteristics of WML across different brain regions. Manual segmentation and analysis of WMLs is laborious and time-consuming; therefore, automated methods providing robust, reproducible, and fast WML segmentation and analysis are highly desirable. In this study, we tackled the segmentation problem as a voxel-based classification problem. We developed an ensemble of different classification models, including six models of support vector machine, trained on handcrafted and transfer learning features, and five models of Residual neural network, trained on varying window sizes. The output of these models was combined through majority-voting. A series of image processing operations was applied to remove false positives in a post-processing step. Moreover, images were mapped to a standard atlas template to quantify the spatial distribution of WMLs, and a radiomic analysis of all the lesions across different brain regions was carried out. The performance of the method on multi-institutional WML Segmentation Challenge dataset (n = 150) comprising T1-weighted and FLAIR images was >90% within data of each institution, multi-institutional data pooled together, and across-institution training–testing. Forty-five percent of lesions were found in the temporal lobe of the brain, and these lesions were easier to segment (95.67%) compared to lesions in other brain regions. Lesions in different brain regions were characterized by their differential characteristics of signal strength, size/shape, heterogeneity, and texture (p < 0.001). The proposed multimodal ensemble-based segmentation of WML showed effective performance across all scanners. Further, the radiomic characteristics of WMLs of different brain regions provide an in vivo portrait of phenotypic heterogeneity in WMLs, which points to the need for precision diagnostics and personalized treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,499
Score d'incertitude au seuil0,231

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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