rs10865331 in 2p15 increases susceptibility to ankylosing spondylitis: a HuGE review and meta-analysis.
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: 2p15 polymorphisms have been reported to increase ankylosing spondylitis (AS) susceptibility in several studies; however, when it comes to whether and how much of this risk exists, the results are inconclusive. The aim of this study is to investigate the correlation between rs10865331 in 2p15 and the risk of AS. METHODS: We conducted a HuGE review and meta-analysis of studies published through September 2019. Studies were identified in PubMed, Scopus, HuGE Navigator, Embase, and Web of Science databases. Odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) for risk estimations were calculated. Sensitivity analysis, subgroup analysis and analysis for potential publication bias were also estimated. RESULTS: Eleven studies with 18555 AS patients and 43777 unrelated healthy individuals, each with a score greater than 6 on the Newcastle-Ottawa Scale (NOS), that investigated the association between rs10865331 in 2p15 and AS were included in our meta-analysis. Data were classified into the genotype analysis cohort, the OR-value cohort, and the pooled analysis cohort, and then a meta-analysis was performed. The OR value of the recessive model in the genotype analysis cohort was 1.376 (95% CI=1.204-1.572, p<0.001, I²=56.30%), and the OR value of the pooled analysis cohort was 1.295 (95% CI=1.228-1.365, p<0.001, I²=73.70%). These findings suggest that individual who carries this single nucleotide polymorphism (SNP) are about 30% more susceptible to developing AS. CONCLUSIONS: Our results suggest that rs10865331 is associated with a significantly higher risk of AS in all race and country subgroups that we have evaluated. Therefore, rs10865331 may be a useful genetic marker for predicting AS susceptibility. However, further studies are needed to confirm our findings.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,019 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,012 | 0,032 |
| Bibliométrie | 0,007 | 0,008 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».