Pregnancy associates with alterations to the host and microbial proteome in vaginal mucosa
Notice bibliographique
Résumé
PROBLEM: Pregnant women are at increased risk of HIV acquisition, but the biological mechanisms contributing to this observation are not well understood. METHOD OF STUDY: Here, we assessed host immune and microbiome differences in the vaginal mucosa of healthy pregnant and non-pregnant women using a metaproteomics approach. Cervicovaginal lavage (CVL) samples were collected from 23 pregnant and 25 non-pregnant women. RESULTS: Mass spectrometry analysis of CVL identified 550 human proteins and 376 bacterial proteins from 11 genera. Host proteome analysis indicated 56 human proteins (10%) were differentially abundant (P < .05) between pregnant and non-pregnant women, including proteins involved in angiogenesis (P = 3.36E-3), cell movement of phagocytes (P = 1.34E-6), and permeability of blood vessels (P = 1.27E-4). The major bacterial genera identified were Lactobacillus, Gardnerella, Prevotella, Megasphaera, and Atopobium. Pregnant women had higher levels of Lactobacillus species (P = .017) compared with non-pregnant women. Functional pathway analysis indicated that pregnancy associated with changes to bacterial metabolic pathway involved in energy metabolism, which were increased in pregnant women (P = .035). CONCLUSION: Overall, pregnant women showed differences in the cervicovaginal proteome and microbiome that may be important for HIV infection risk.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».