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Enregistrement W3010839774 · doi:10.1016/j.cjca.2020.03.001

Genomics of Blood Pressure and Hypertension: Extending the Mosaic Theory Toward Stratification

2020· review· en· W3010839774 sur OpenAlexvenueno aff
Stefanie Lip, Sandosh Padmanabhan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Cardiology · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal Regulation and Hypertension
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilBritish Heart Foundation
Mots-clésGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismGeneticsGenetic associationMedicineAldosteroneSNPBiologyBioinformaticsGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genetic architecture of blood pressure (BP) now includes more than 30 genes, with rare mutations resulting in inherited forms of hypertension or hypotension, and 1477 common single-nucleotide polymorphisms (SNPs). These signify the heterogeneity of the BP phenotype and support the mosaic theory of hypertension. The majority of monogenic syndromes involve the renin-angiotensin-aldosterone system and the adrenal glucocorticoid pathway, and a smaller fraction are due to rare neuroendocrine tumours of the adrenal glands and the sympathetic and parasympathetic paraganglia. Somatic mutations in genes coding for ion channels (KCNJ5 and CACNA1D) and adenosine triphosphatases (ATP1A1 and ATP2B3) highlight the central role of calcium signalling in autonomous aldosterone production by the adrenal gland. The per-SNP BP effect is small for SNPs according to genome-wide association studies (GWAS), and all of the GWAS-identified BP SNPs explain ∼ 27% of the 30%-50% estimated heritability of BP. Uromodulin is a novel pathway identified by GWAS, and it has now progressed to a genotype-directed clinical trial. The majority of the GWAS-identified BP SNPs show pleiotropic associations, and unravelling those signals and underpinning biological pathways offers potential opportunities for drug repurposing. The GWAS signals are predominantly from Europe-centric studies with other ancestries underrepresented, however, limiting the generalisability of the findings. In this review, we leverage the burgeoning list of polygenic and monogenic variants associated with BP regulation along with phenome-wide studies in the context of the mosaic theory of hypertension, and we explore potential translational aspects that underlie different hypertension subtypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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