MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3010993131 · doi:10.1038/s42003-020-0842-3

Loss of the branched-chain amino acid transporter CD98hc alters the development of colonic macrophages in mice

2020· article· en· W3010993131 sur OpenAlexaff
Philipp Wuggenig, Berna Kaya, Hassan Melhem, C. Korcan Ayata, Karim Abdelrahman, Gentiana Ademi, Patrick Aepli, Claudia Anderegg, Anca-Teodora Antonino, Eva Archanioti, Eviano Arrigoni, Diana Bakker de Jong, Bruno M. Balsiger, Polat Bastürk, Peter Bauerfeind, Andrea Becocci, Dominique C. Belli, José M. Bengoa, Luc Biedermann, Janek Binek, Mirjam Blattmann, Stephan Boehm, Tujana Boldanova, Jan Borovicka, Christian Braegger, Stephan Brand, Lukas Brügger, Simon Brunner, Patrick Bühr, Sabine Burk, Bernard Burnand, Emanuel Burri, Sophie Buyse, Dahlia-Thao Cao, Ove Carstens, Dominique Criblez, Sophie Cunningham, Fabrizia D’Angelo, Philippe de Saussure, Lukas Degen, Joakim Delarive, Christopher Doerig, Barbara Dora, Susan Drerup, Mara Egger, Ali El-Wafa, Matthias Engelmann, Jessica Ezri, Christian Felley, Markus Fliegner, Nicolas Fournier, Montserrat Fraga, Yannick Franc, Remus Frei, Pascal Frei, Michael Fried, Florian Froehlich, Raoul I. Furlano, Luca Garzoni, Martin Geyer, Laurent Girard, Marc Girardin, Delphine Golay, Ignaz Good, Ulrike Graf Bigler, Beat Gysi, Johannes Haarer, Marcel Halama, Janine Haldemann, Pius Heer, Benjamin Heimgartner, Beat Helbling, Peter Hengstler, Denise Herzog, Cyrill Hess, Roxane Hessler, Klaas Heyland, Thomas Hinterleitner, Claudia Hirschi, Petr Hrúz, Pascal Juillerat, Stephan Kayser, Céline Keller, Carolina Khalid-de Bakker, Christina Knellwolf, Christoph Knoblauch, Henrik Köhler, Rebekka Koller, Claudia Krieger, Patrizia Künzler‐Heule, Rachel Kusche, Frank Serge Lehmann, Andrew J. Macpherson, Michel H. Maillard, Astrid Marot, Rémy Meier, Christa Meyenberger, Pamela A. Meyer, Pierre Michetti, Benjamin Misselwitz, Patrick Mosler, Christian Mottet, Christoph Müller, Beat Müllhaupt, Leilla Musso, Michaela Neagu, Cristina Nichita, Jan Hendrik Niess, Andreas Nydegger, Nicole Obialo, Diana Ollo, Cassandra Oropesa, Ulrich Peter, Daniel Peternac, Laetitia Marie Petit, Valérie Pittet, Daniel Pohl, Marc Porzner, Claudia Preissler, Nadia Raschle, Ronald Rentsch, Sophie Restellini, Alexandre Restellini, Jean-Pierre Richterich, Frédéric Ris, Branislav Risti, Marc Alain Ritz, Gerhard Rogler, Nina Röhrich, Jean‐Benoît Rossel, Vanessa Rueger, Monica Rusticeanu, Markus Sagmeister, Gaby Saner, Bernhard Sauter, Mikael Sawatzki, Michael Scharl, Martin Schelling, Susanne Schibli, Hugo Schlauri, Dominique Schluckebier, Sybille Schmid, Daniela Schmid, Jean-François Schnegg, Alain Schoepfer, Vivianne Seematter, Frank Seibold, Mariam Seirafi, Gian-Marco Semadeni, Arne Senning, Christiane Sokollik, Joachim R. Sommer, Johannes Spalinger, Holger Spangenberger, Philippe Stadler, Peter Staub, Dominic Staudenmann, Volker Stenz, Michael Steuerwald, Alex Straumann, Bruno Strebel, Andreas Stulz, Michael Christian Sulz, Aurora Tatu, Michela Tempia-Caliera, Amman Thomas, Joël Thorens, Kaspar Truninger, Radu Țuțuian, Patrick Urfer, Stephan R. Vavricka, Francesco Viani, Jürg Vögtlin, Roland von Känel, Dominique Vouillamoz, Rachel Vulliamy, Paul Wiesel, Reiner Wiest, Stefanie Wöhrle, Tina Wylie, Samuel A. Zamora, Silvan Zander, Jonas Zeitz, Dorothee Zimmermann, Emre Sayan, Hideki Tsumura, Morihiro Ito, Julien Roux, Jan Hendrik Niess

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensOnex (Canada)
Organismes subventionnairesEidgenössische Technische Hochschule ZürichSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungUniversität Basel
Mots-clésCX3CR1MacrophageBiologyImmune systemTransporterMonocyteCell biologyGeneImmunologyBiochemistryChemokine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Comprehensive development is critical for gut macrophages being essential for the intestinal immune system. However, the underlying mechanisms of macrophage development in the colon remain elusive. To investigate the function of branched-chain amino acids in the development of gut macrophages, an inducible knock-out mouse model for the branched-chain amino acid transporter CD98hc in CX3CR1 + macrophages was generated. The relatively selective deletion of CD98hc in macrophage populations leads to attenuated severity of chemically-induced colitis that we assessed by clinical, endoscopic, and histological scoring. Single-cell RNA sequencing of colonic lamina propria macrophages revealed that conditional deletion of CD98hc alters the “monocyte waterfall”-development to MHC II + macrophages. The change in the macrophage development after deletion of CD98hc is associated with increased apoptotic gene expression. Our results show that CD98hc deletion changes the development of colonic macrophages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,091
Score d'incertitude au seuil0,578

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCommunications BiologyMême sujetImmune cells in cancerTravaux en français237 207