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Enregistrement W3011019145 · doi:10.1101/2020.03.11.987602

Role of syndecan-1 in the interaction between dendritic cells and T cells

2020· preprint· en· W3011019145 sur OpenAlexfundno aff
M. Kouwenberg, Angelique L. Rops, Marinka Bakker-van Bebber, Laura E. Diepeveen, Martin Götte, Luuk B. Hilbrands, Johan van der Vlag

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Infection and ImmunityNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekRadboud UniversiteitZonMw
Mots-clésSyndecan 1T cellCell biologyDendritic cellFlow cytometryChemokineChemistryMixed lymphocyte reactionCytokineImmunologyCellBiologyAntigenImmune systemBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Syndecan-1 (Sdc-1) is a heparan sulfate proteoglycan that can bind cytokines and chemokines via its heparan sulfate side chains, and has immunomodulatory properties in experimental models. Sdc-1 expression has been reported on dendritic cells (DC) and T cells. The potential role of Sdc-1 in DC - T cell interaction has not been investigated yet. We postulate that Sdc-1 is involved in DC – T cell interaction and may influence graft survival in an allogeneic transplant model. Sdc-1 expression on bone marrow-derived DC and T cells was analyzed by flow cytometry. Unstimulated and LPS stimulated Sdc-1 deficient DC were evaluated in vitro for phenotype and stimulatory capacity in mixed lymphocyte reaction. Sdc-1 deficient T cells were evaluated for proliferative capacity and differentiation in a mixed lymphocyte reaction and a proliferation assay. Allograft survival was evaluated in a fully MHC mismatched heterotopic heart transplant model, with either Sdc-1 deficient donors or recipients. Sdc-1 is expressed on the cell surface of unstimulated and LPS matured DC. Sdc-1 deficiency had no effect on expression of co-stimulatory molecules, cytokine production or T cell stimulatory capacity as compared to WT DC. Sdc-1 expression was not detectable on WT T cells, although intracellular Sdc-1 expression could be demonstrated after ConA activation. Sdc-1 deficient T cells showed reduced proliferation upon DC or ConA stimulation and reduced IL-17 production upon ConA stimulation, compared to WT T cells. Sdc-1 deficiency of either allograft or recipient did not prolong allograft survival. In conclusion, Sdc-1 is expressed on the cell surface of DC, where its absence does not affect DC phenotype or T cell stimulatory capacity. Sdc-1 is intracellularly expressed in ConA activated T cells. Sdc-1 deficiency in T cells results in a reduced proliferative response in vitro , as induced by DC and ConA. Sdc-1 deficiency in donor or recipient does not affect allograft survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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